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[新手求助] Gaussian计算反应速率常数 求助

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发表于 2019-7-10 12:45:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
      各位老师好,最近我读到sob老师的一篇名为 使用KiSThelP结合Gaussian基于过渡态理论计算反应速率常数 的帖子,里面关于 TST部分 获取 TS.out 文件这一点我有一个疑问如下:这个过渡态输出文件的获取是否只能采用TS方法,可否使用 qst2方法?换言之 可否理解为只要获取到过渡态out.文件即可,无所谓方法。         我不是化学类专业,但课题研究有交叉,量化方面涉猎很浅,我知道卢老师好像不太推荐qst2,使用TS的话需要对过渡态有一定的预判和直觉,但我觉得我没有,所以想使用qst2。 我现在已知  双分子反应物,以及多种生成物,要找这个过渡态

      谢谢老师

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发表于 2019-7-10 13:07:26 | 显示全部楼层
只要最终找到过渡态即可,哪怕是开上帝之眼,直接构造出最终过渡态结构都可以。
另外需要注意的是,判断过渡态是否正确、是否自己想要的过渡态,要看虚频数目(有且仅有一个)、观看虚频对应的振动模式是否正确 和 跑IRC。

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发表于 2019-7-10 20:15:05 | 显示全部楼层
实际上你只要多看几个opt=TS的例子,就足矣在大多数情况下手动摆出比QST2自动给出的初猜更合理的过渡态初猜结构。观点我在这里阐明了
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html
用QST2之前至少要先会用opt=TS

当然如果对于你的体系恰好用QST2比较方便,那你就用QST2 freq的任务也可以,kisthelp应该也能认

实际上对于大多数情况没有必要用kisthelp,直接用我的excel表格(http://sobereva.com/310)来算k就足够了,用kisthelp还稍微麻烦点

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 楼主| 发表于 2019-7-10 20:22:01 | 显示全部楼层
zjxitcc 发表于 2019-7-10 13:07
只要最终找到过渡态即可,哪怕是开上帝之眼,直接构造出最终过渡态结构都可以。
另外需要注意的是,判断过 ...

我了解了,谢谢您的解答

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 楼主| 发表于 2019-7-10 20:23:52 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-7-10 20:15
实际上你只要多看几个opt=TS的例子,就足矣在大多数情况下手动摆出比QST2自动给出的初猜更合理的过渡态初猜 ...

好的老师,我会再深入学习和尝试,谢谢您
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