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[GROMACS] 请教使用Green-kubo方程计算黏度的问题

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发表于 2019-7-11 16:17:41 | 显示全部楼层 |阅读模式
查了些资料好多人用Lammps来计算黏度,目前我想用c++做编程,请问有没有人做过这面的工作,可以给出一点建议。

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公社社长

发表于 2019-7-11 18:35:15 | 显示全部楼层
一些数值细节在此文里交代得比较充分,可以参考
Molecular Simulation, Vol. 33, No. 15, December 2007, 1261–1266
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发表于 2019-7-16 15:01:48 | 显示全部楼层
Reliable Viscosity Calculation from Equilibrium Molecular Dynamics Simulations: A Time Decomposition Method
DOI: 10.1021/acs.jctc.5b00351 J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 3537−3546
解释了这个公式以及实际应用中的一些问题,看他的参考文献可以很好的理解这一过程。

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 楼主| 发表于 2019-7-26 09:21:17 | 显示全部楼层
Recycled 发表于 2019-7-16 15:01
Reliable Viscosity Calculation from Equilibrium Molecular Dynamics Simulations: A Time Decomposition ...

我还想请教您一下用G-K去计算的话,首先需要拟合一下压力与t的函数关系式对吗?这个有没么公式吗?
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