程序小白求助

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-2 21:36:01

各位老师：
      非常不好意思，学生对编程十足的小白，近来看文献有以下计算方法：
Computational methods：
   The search for the global minima of H2Bn (8 ≤ n ≤ 12) was performed using the simulated annealing algorithm. Up to 2000 structures were initially optimized using the PBE0 hybrid density functional38−40 and the 3-21G basis set41 as implemented in the Gaussian 09 program.
   想请教各位老师：作者是不是采用了模拟退火算法与第一性原理分子动力学相结合,来搜索H2Bn的全局最小。想使用这种方法，是不是需要自己编程呀，

，。那位好心老师能帮我一下。不胜感激。

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-2 22:42:11

就是模拟退火+从头算动力学。

只要你做从头算动力学模拟的程序支持热浴，以及支持变温设定，就可以直接做模拟退火，至多自己写个脚本来让反复升温、降温、提取结构的过程自动化。

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-2 23:15:06

sobereva 发表于 2015-7-2 22:42
就是模拟退火+从头算动力学。

只要你做从头算动力学模拟的程序支持热浴，以及支持变温设定，就可以直接 ...

谢谢sobereva 老师，可是我自己不会写程序，

，您能提供这方面的技术支持吗？我知道这个要求很过分，希望没有冒犯您。

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-2 23:20:42

帮助开发程序就属于科音的付费业务了。由于近期要忙8月份培训班的事，暂时抽不出时间弄。

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-2 23:25:18

sobereva 发表于 2015-7-2 23:20
帮助开发程序就属于科音的付费业务了。由于近期要忙8月份培训班的事，暂时抽不出时间弄。

奥，这是应该的，能咨询一下这方面的付费业务大约多少钱吗？

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-3 00:28:43

zidu113 发表于 2015-7-2 23:25
奥，这是应该的，能咨询一下这方面的付费业务大约多少钱吗？

这得看具体情况了，不好说，过程不复杂时一般是几百

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-3 00:33:13

sobereva 发表于 2015-7-3 00:28
这得看具体情况了，不好说，过程不复杂时一般是几百

奥，好的，sobereva 老师。您先休息，我明天给您发邮件，详谈。再次感谢您。

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-3 10:37:39

sobereva 发表于 2015-7-3 00:28
这得看具体情况了，不好说，过程不复杂时一般是几百

sobereva 老师,您好，刚才我给您发了一封邮件<sobereva@sina.com> ，咨询关于程序开发的问题，麻烦您能在方便的时间回复学生，谢谢。

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-3 18:25:51

sobereva 发表于 2015-7-2 22:42
就是模拟退火+从头算动力学。

只要你做从头算动力学模拟的程序支持热浴，以及支持变温设定，就可以直接 ...

sobereva老师，今天看文献，好像VASP程序支持模拟退火算法+第一性原理分子动力学。请问您了解VASP吗？

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-4 16:18:12

zidu113 发表于 2015-7-3 18:25
sobereva老师，今天看文献，好像VASP程序支持模拟退火算法+第一性原理分子动力学。请问您了解VASP吗？

VASP我不怎么用。这部分问题你可以在第一性原理版发帖，那里有很多VASP用户

zidu113 · 发表于 Post on 2015-7-4 18:06:05

sobereva 发表于 2015-7-4 16:18
VASP我不怎么用。这部分问题你可以在第一性原理版发帖，那里有很多VASP用户

谢谢sobereva 老师的指点，

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