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[算法与编程] libcint的使用求助

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发表于 2019-7-16 20:31:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位走过路过的大佬好啊,本人新手,想尝试自己编写一些算法程序例如 (HF,MP2) 等,我不是专门做算法的,只是想深入的理解理论,所以计划直接采用现成的libcint电子积分库,奈何组里没有前辈,暂时也没找到好的资料,还请各位大佬指点一下如何使用该电子积分库,若有好的资料分享,感激不尽!

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发表于 2019-7-16 20:53:30 | 显示全部楼层
没用过,都是自己写的。

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发表于 2019-7-16 21:59:03 | 显示全部楼层
安装包里自带了一个简单的说明,可以试着看看能不能看懂。积分库需要的是原子核坐标信息和相应的基函数信息,你要做的是根据这些信息准备atm,bas和env三个数组,传给相应的函数就可以了。我是用Fortran的,C的原理基本一样,我不知道你掌握到何种程度,不知道可以给你分享多少。

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发表于 2019-7-17 02:13:22 | 显示全部楼层
有一定量化编程基础(比如能自己写出动能积分代码),看看libcint自带的例子文件和手册,有足够悟性就能调用libcint
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
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 楼主| 发表于 2019-7-17 10:06:38 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-7-17 02:13
有一定量化编程基础(比如能自己写出动能积分代码),看看libcint自带的例子文件和手册,有足够悟性就能调 ...

目前几乎没有量化编程基础,我是不是应该先看一下这方面的书籍呢?就看过彭的书,感谢

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 楼主| 发表于 2019-7-17 10:07:07 | 显示全部楼层
Warm_Cloud 发表于 2019-7-16 20:53
没用过,都是自己写的。

大师大法好

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 楼主| 发表于 2019-7-17 10:10:18 | 显示全部楼层
niobium 发表于 2019-7-16 21:59
安装包里自带了一个简单的说明,可以试着看看能不能看懂。积分库需要的是原子核坐标信息和相应的基函数信息 ...

你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了解的,不知道如何用程序来实现。

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发表于 2019-7-17 10:19:28 | 显示全部楼层
薛定谔的老猫 发表于 2019-7-17 10:10
你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了 ...

(1)Szabo的Mordern Quantum Chemistry, 第三章RHF讲的很详细;
(2)论坛里有几个人都上传过自己的HF,MP2编程笔记等资料,值得一看。
(3)仔细阅读libint2,libcint等积分库的说明。

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 楼主| 发表于 2019-7-17 10:31:04 | 显示全部楼层
zjxitcc 发表于 2019-7-17 10:19
(1)Szabo的Mordern Quantum Chemistry, 第三章RHF讲的很详细;
(2)论坛里有几个人都上传过自己的HF ...

好的,我再琢磨琢磨,不会再来请教,可惜只能抽空弄啊!感谢

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发表于 2019-7-17 10:37:47 | 显示全部楼层
薛定谔的老猫 发表于 2019-7-17 10:10
你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了 ...

建议先写MP2,熟悉量化公式如何转为程序。可以从现成的程序读取HF结果。
直接写SCF可能会打消你的积极性,毕竟现在成熟程序的SCF都比较强大,你很难超越,加速技巧也比较多,会比较费时间。
当然,MP2要能写出算200个基函数和2000个基函数的程序也是要花不同的时间的,但相对容易很多。

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 楼主| 发表于 2019-7-17 10:52:52 | 显示全部楼层
niobium 发表于 2019-7-17 10:37
建议先写MP2,熟悉量化公式如何转为程序。可以从现成的程序读取HF结果。
直接写SCF可能会打消你的积极性 ...

好的,感谢建议

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发表于 2019-7-18 21:49:16 | 显示全部楼层
薛定谔的老猫 发表于 2019-7-17 10:10
你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了 ...

其实自己写不写出来程序和对理论理解的深度没有必然关系
诸如双电子积分,就是那么个数学公式而已,写出来只是增强编程水平和对积分在数学、数值算法上的理解,但并不提升对理论方法的理解。
所以如果最终目的也不是写个有实用性的量化程序,考虑到你现在对编程也不通,花那么多精力自己编程写完整的DFT计算程序真没必要,这些时间还不如再多看理论方面的书籍和文献来增进对理论的理解,这更有实际意义。
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发表于 2019-7-22 08:25:44 | 显示全部楼层
写了个简单的使用教程,希望对你有用

https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... 5&lang=zh_CN#rd

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 楼主| 发表于 2019-7-25 22:05:03 | 显示全部楼层
niobium 发表于 2019-7-22 08:25
写了个简单的使用教程,希望对你有用

https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU5NjMxNjkzMw==&mid=22474845 ...

哇,非常感谢

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发表于 2019-7-25 23:16:28 | 显示全部楼层
PS:过几个月,两年前写了一半的《量子化学程序编写入门》会写完然后发布在网上。里面的程序就是基于libcint作为双电子积分计算模块的,到时候会结合例子讲得很详细
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