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楼主 Author: sobereva
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[ORCA] OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-8 11:48:51 | 只看该作者 Only view this author
yisui 发表于 2022-1-8 10:25
sob老师,使用OfakeG转换后Gview显示报错,请问是什么原因,multiwfn显示无虚频。

我更新了官网上的OfakeG,可以处理你的文件了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-1-8 14:03:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-8 11:48
我更新了官网上的OfakeG,可以处理你的文件了

sob老师,现已能正常使用,十分感谢!!!

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发表于 Post on 2022-1-15 11:24:53 | 只看该作者 Only view this author
用ORCA计算的IRC,现在有软件能够图形呈现出来吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-15 20:39:18 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-1-15 11:24
用ORCA计算的IRC,现在有软件能够图形呈现出来吗?

VMD
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发表于 Post on 2022-1-16 10:48:04 | 只看该作者 Only view this author

有教程吗,我的VMD都打不开ORCA输出文件

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-16 12:22:34 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-1-16 10:48
有教程吗,我的VMD都打不开ORCA输出文件

显然是打开xyz文件
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发表于 Post on 2022-1-16 12:35:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-16 12:22
显然是打开xyz文件

好了,感谢Sob老师

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发表于 Post on 2022-2-12 22:23:01 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我的文件转化后optimization显示灰色。试了一下example里的out文件转化后也是显示灰色

Ru-PyCN-opt_fake.out

408.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-13 03:18:21 | 只看该作者 Only view this author
zongxupeng 发表于 2022-2-12 22:23
老师好,我的文件转化后optimization显示灰色。试了一下example里的out文件转化后也是显示灰色

那是因为你没选择read intermediate geometries,最基本的gview使用常识
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发表于 Post on 2022-2-15 14:38:26 | 只看该作者 Only view this author
ORCA 快要发布5.0.3了,文中所提及的“OfakeG以后版本也有可能支持处理ORCA的IRC任务的输出文件”会不会在近期的版本中实现呢。
又菜又爱玩

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发表于 Post on 2023-4-4 20:49:36 | 只看该作者 Only view this author
建议你把“伪造”改为“转换”。格式转换比伪造用着舒服。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-5 06:42:17 | 只看该作者 Only view this author
shuiningzhu 发表于 2023-4-4 20:49
建议你把“伪造”改为“转换”。格式转换比伪造用着舒服。

不接受建议,词不达意
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发表于 Post on 2023-9-1 10:09:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 霜晨月 于 2023-9-1 11:18 编辑

跟社长报告一个问题:几何优化时如果使用了recalc_hess,OfakeG就会仅仅输出第一次recalc_hess之前的结果;比如,如果用recalc_hess 5,OfakeG就仅输出前6帧。

查看从前的帖子,有老师已经提出这个问题,社长说已经在1.0.6版本中解决了,但好像当时只有ORCA 4。我现在用的是ORCA 5.0.3,最新的OfakeG 1.0.9和稍早的1.0.8都有这个问题。是不是ORCA升级到5时这个bug又出现了?

更正:
我又仔细检查了我的任务文件,发现如果只写recalc_hess的话,OfakeG是可以正常转化的;但如果同时用了Hybrid_Hess关键词,就会出现上述bug。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-6 23:42:53 | 只看该作者 Only view this author
霜晨月 发表于 2023-9-1 10:09
跟社长报告一个问题:几何优化时如果使用了recalc_hess,OfakeG就会仅仅输出第一次recalc_hess之前的结果; ...

此程序不考虑Hybrid_Hess之类非常小众的情况
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发表于 Post on 2024-1-24 15:04:07 | 只看该作者 Only view this author
报告一个ORCA采用QM/MM计算频率时,无法生成频率信息的问题(1.0.9版本)。
详见附件

问题汇报.zip

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