计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11940|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 请问:研究相互作用能是用真空环境还是控压?

[复制链接 Copy URL]

384

帖子

0

威望

3364

eV
积分
3748

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 yihanxu 于 2019-7-17 08:30 编辑

老师好,如果想研究298.15K下两种物质的相互作用能,是在真空研究、还是建立充满两种物质的盒子然后用NPT在1bar压力下做研究?两种方法的结果会有不同吗?
live each day as if it was your last

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125125

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2019-7-17 22:33:36 | 只看该作者 Only view this author
如果是气相,1bar对应的浓度非常低,没法靠MD用于实际分析。真空下模拟就完了

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
yihanxu + 5

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

384

帖子

0

威望

3364

eV
积分
3748

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-18 11:02:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-17 08:33
如果是气相,1bar对应的浓度非常低,没法靠MD用于实际分析。真空下模拟就完了

谢谢老师!
live each day as if it was your last

384

帖子

0

威望

3364

eV
积分
3748

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-18 14:53:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-17 08:33
如果是气相,1bar对应的浓度非常低,没法靠MD用于实际分析。真空下模拟就完了

谢谢老师。
请问为什么是气相呢?固相、液相呢?
可以对比在真空下和在显示溶剂中的相互作用能来得出溶剂对相互作用能的影响吗?
live each day as if it was your last

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125125

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2019-7-18 21:57:49 | 只看该作者 Only view this author
yihanxu 发表于 2019-7-18 14:53
谢谢老师。
请问为什么是气相呢?固相、液相呢?
可以对比在真空下和在显示溶剂中的相互作用能来得出溶 ...

就是指在当前温度、压力下你当前模拟的物质是什么状态。

可以

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
yihanxu + 5 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

384

帖子

0

威望

3364

eV
积分
3748

Level 5 (御坂)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-18 22:41:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-18 07:57
就是指在当前温度、压力下你当前模拟的物质是什么状态。

可以

常温常压下两种物质及其混合物是固态,这样的话也是用真空模拟就好吗?用真空模拟和用NPT模拟会有什么不同吗?谢谢老师。
live each day as if it was your last

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125125

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2019-7-18 22:47:42 | 只看该作者 Only view this author
yihanxu 发表于 2019-7-18 22:41
常温常压下两种物质及其混合物是固态,这样的话也是用真空模拟就好吗?用真空模拟和用NPT模拟会有什么不 ...

有所不同
固相下周围的分子会对当前分子的电荷分布有一定极化作用

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
yihanxu + 2 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-18 06:12 , Processed in 0.225926 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list