求助关于用ORCA几何优化

晓滨MD · 发表于 Post on 2019-7-22 21:42:20

新手刚刚开始学用ORCA，根据sob老师的方法产生的输入文件，基组是B97-3c，对几个有机小分子进行了几何优化和振动分析，有几个问题想请教各位老师：
1.怎样通过ORCA的输出文件判断几何优化和SCF收敛？
2.几何优化完成之后，会产生优化完的.xyz结构文件，我想用优化完的结构文件交给antechamber产生拓扑文件，试了好几种方法一直不成功，还请各位老师指点一下。

sobereva · 发表于 Post on 2019-7-23 17:40:57

计算没报错，正常结束的话，自然几何优化收敛了，而且每步也都SCF收敛了
用openbabel之类转换成mol2格式，就能当antechamber输入文件了

晓滨MD · 发表于 Post on 2019-7-23 18:30:12

sobereva 发表于 2019-7-23 17:40
计算没报错，正常结束的话，自然几何优化收敛了，而且每步也都SCF收敛了
用openbabel之类转换成mol2格式， ...

谢谢老师

量化小菜鸡 · 发表于 Post on 2019-7-24 17:07:56

你仔细读输出文件，假如几何不收敛跑过了圈数。最后有个warning。

晓滨MD · 发表于 Post on 2019-7-24 17:10:26

量化小菜鸡发表于 2019-7-24 17:07
你仔细读输出文件，假如几何不收敛跑过了圈数。最后有个warning。

好的，谢谢

biogon · 发表于 Post on 2019-7-25 12:55:12

量化小菜鸡发表于 2019-7-24 17:07
你仔细读输出文件，假如几何不收敛跑过了圈数。最后有个warning。

orca优化不收敛是不是跑过了圈数只提示个warning？

量化小菜鸡 · 发表于 Post on 2019-7-25 15:40:00

biogon 发表于 2019-7-25 12:55
orca优化不收敛是不是跑过了圈数只提示个warning？

印象里还会继续算，给你个最后输出。所以最好自己看一下。

Xian · 发表于 Post on 2019-8-7 11:16:19

楼主注意啦，我优化一个结构，虽然程序正常结束，但是有这个warning

----------------------------------------------------------------------------
                              WARNING !!!
   The optimization did not converge but reached the maximum number of
   optimization cycles.
   Please check your results very carefully.
----------------------------------------------------------------------------

其实结构是没有优化好的呢。

晓滨MD · 发表于 Post on 2019-8-9 09:17:50

Xian 发表于 2019-8-7 11:16
楼主注意啦，我优化一个结构，虽然程序正常结束，但是有这个warning

------------------------------ ...

嗯嗯，好的谢谢。每次优化完都会检查输出文件

喵星大佬 · 发表于 Post on 2020-8-28 08:53:06

晓滨MD 发表于 2019-8-9 09:17
嗯嗯，好的谢谢。每次优化完都会检查输出文件

B97-3c这个方法蛮容易几何优化不收敛的。可能是用了RI导致数值噪音比较大的原因吧。优化小配合物分子也经常要几百步

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