关于用太赫兹时域光谱技术（THz-TDS）发文章的感想及毕业论文的困惑？

wei · 发表于 Post on 2019-8-28 16:34:29

Daxiong 发表于 2019-8-28 14:53
我想请教一下，ccdc上没有晶胞结构，在高斯里面进行单分子模拟，怎么做成晶胞进行模拟？

试试MS里的polymorph模块或者USPEX

zhutuziqin · 发表于 Post on 2019-11-29 11:15:11

MilkTeaLegend 发表于 2019-8-9 13:03
个人觉得周期性的系统做cpmd 基于动力学计算振动光谱更靠谱

不好意思抱歉回复这么晚了你说的这个我下来再仔细了解一下

zhutuziqin · 发表于 Post on 2019-11-29 11:28:54

wei 发表于 2019-8-24 10:45
我做过类似的体系，有点经验。1. 结构优化是一定要用周期性的全优化，我觉得周期性只优化H原子也是不太好。 ...

非常抱歉这么迟才回复您
第1点全优化和普通的结构优化有什么区别和联系这个是我要搞清楚的软件的话咱们学校只有Gaussian QE可以尝试一下其他的短期内不太可能
第2点您做的方向肯定和我们还有差距的在计算资源上面就有了挖超胞用sob老师帖子里面的那个应该是可以的http://bbs.keinsci.com/thread-11390-1-1.html
第3点计算资源一台32C64W 128G内存 Gaussian09 乌班图系统可以吗
第4点我们实验室的条件有限只能做常温的太赫兹时域光谱拉曼和变温红外都做不了

以上您提出的建议我会尝试部分我们实验条件允许的谢谢

zhutuziqin · 发表于 Post on 2019-11-29 11:34:38

Daxiong 发表于 2019-8-28 14:53
我想请教一下，ccdc上没有晶胞结构，在高斯里面进行单分子模拟，怎么做成晶胞进行模拟？

在CCDC 3D visualiser页面点击右键有packing的哦

另外在Mercury 软件里面 calculate-packing 也可以成晶胞的

zhutuziqin · 发表于 Post on 2020-3-1 18:53:10

MilkTeaLegend 发表于 2019-8-9 13:03
个人觉得周期性的系统做cpmd 基于动力学计算振动光谱更靠谱

小硕即将毕业，若能顺利读博的话，会优先考虑做一些更加可靠全面的分析的。

conis · 发表于 Post on 2023-11-29 08:44:45

我想问一下，thz怎么通过gaussian设计

conis · 发表于 Post on 2023-11-29 08:51:10

学长，我是23级研究生，看到你的帖子我深有感触，
我做的方向与你一样，也是通过gaussian得到太赫兹频率，与实验光谱进行对比，但是我通过gaussian得到的频率范围是0-4000，通过gaussview转化为thz频率之后与实验得到的光谱吸收峰不一致。我也想得到远红外的计算频率，该怎么办。
可以请教一下学长吗

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-3 01:03:55

conis 发表于 2023-11-29 08:51
学长，我是23级研究生，看到你的帖子我深有感触，
我做的方向与你一样，也是通过gaussian得到太赫兹频率， ...

太赫兹用Gaussian根本算不了
用簇模型算THz这几年开始已经不被接受了。CP2K直接对晶体做振动分析是最好选择，论坛首页google框搜我的相关回帖。北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里讲振动分析的部分专门给了太赫兹计算介绍和完整例子

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