请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 898|回复: 15

[xtb] 这个xTB的PBC还有待完善

[复制链接]

113

帖子

5

威望

1387

eV
积分
1600

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-6 07:22:48 | 显示全部楼层 |阅读模式
试了个最简单的苯晶体,结果还算不错。
但是换了个复杂的,比如一个400原子的金属氧化物,就立即segment fault,连ulimit -s unlimited都不管用 (64GB内存应该够了吧)。

不过有这个快速半经验的固体计算程序已经很令人激动了,估计最慢一年的时间这个程序就能完善。到时候就大有可为。

82

帖子

0

威望

1329

eV
积分
1411

Level 4 (黑子)

发表于 2019-8-6 09:19:09 | 显示全部楼层
可以带PBC跑动力学吗

115

帖子

0

威望

395

eV
积分
510

Level 4 (黑子)

发表于 2019-8-6 09:57:24 | 显示全部楼层
建议楼主测试一下mopac的pbc
看看哪个速度快些...

123

帖子

0

威望

1573

eV
积分
1696

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-6 10:18:04 | 显示全部楼层
用xtb主要是有金属的参数

451

帖子

3

威望

4959

eV
积分
5470

Level 6 (一方通行)

发表于 2019-8-6 12:17:47 来自手机 | 显示全部楼层
现在只能做几何优化吧

191

帖子

0

威望

601

eV
积分
792

Level 4 (黑子)

发表于 2019-8-6 14:05:26 | 显示全部楼层
h840473807 发表于 2019-8-6 09:19
可以带PBC跑动力学吗

好像还不行

136

帖子

0

威望

1564

eV
积分
1700

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-6 15:42:20 | 显示全部楼层
老版本删的太快,gfn0参数没了

162

帖子

0

威望

844

eV
积分
1006

Level 4 (黑子)

发表于 2019-8-6 15:56:34 | 显示全部楼层
yjmaxpayne 发表于 2019-8-6 15:42
老版本删的太快,gfn0参数没了

附件是前几天论坛里另一个帖子有人回复的,请自取

param_gfn0.rar

12.06 KB, 下载次数: 6

136

帖子

0

威望

1564

eV
积分
1700

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-7 06:53:06 | 显示全部楼层
Novice 发表于 2019-8-6 15:56
附件是前几天论坛里另一个帖子有人回复的,请自取

多谢

123

帖子

0

威望

1573

eV
积分
1696

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-7 08:22:35 | 显示全部楼层
更新以后可以啊

136

帖子

0

威望

1564

eV
积分
1700

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-7 14:45:21 | 显示全部楼层
8月6号的Bug修正版挺好,gfn0参数也有了。

162

帖子

0

威望

844

eV
积分
1006

Level 4 (黑子)

发表于 2019-8-7 14:56:17 | 显示全部楼层
yjmaxpayne 发表于 2019-8-7 14:45
8月6号的Bug修正版挺好,gfn0参数也有了。

这个修正版里面包含的文件怎么这么少,怎么没有GFNx的文件了?但却多了一些其他的文件,难道是用来替换的?

136

帖子

0

威望

1564

eV
积分
1700

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-7 16:06:27 | 显示全部楼层
Novice 发表于 2019-8-7 14:56
这个修正版里面包含的文件怎么这么少,怎么没有GFNx的文件了?但却多了一些其他的文件,难道是用来替换的 ...

应该是,参数文件啥的,都包含在前一个版本了。

88

帖子

0

威望

2061

eV
积分
2149

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-8 11:43:28 | 显示全部楼层
h840473807 发表于 2019-8-6 09:19
可以带PBC跑动力学吗

如果用ase的接口,可以跑pbc的动力学

136

帖子

0

威望

1564

eV
积分
1700

Level 5 (御坂)

发表于 2019-8-14 10:01:48 | 显示全部楼层
最近跑了几个PBC的测试,大体系(~400原子),效率不够高,12个核并行只有2X多的加速。小体系(~60原子),并行效率还可以,8核8倍加速。
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949-1号 )

GMT+8, 2019-12-8 01:59 , Processed in 0.153735 second(s), 26 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表