请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 198|回复: 3

[Gaussian/gview] 求助 柔性扫描找ts,结果看着像没有ts,想问变量是否设置正确?

[复制链接]

38

帖子

0

威望

590

eV
积分
628

Level 4 (黑子)

发表于 2019-8-10 09:00:01 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 哈哈哈 于 2019-8-10 10:41 编辑

想找一个H从N上提取到O上反应的过渡态,用OPT=TS方法没找到,想用柔性扫描试试。
先优化了H与OH成键的结构,然后走H由O到N的柔性扫描。
文件中是柔性扫描的输出,从结果上看没有过渡态,我想这个应该有个过渡态哦,所以想问问是否我柔性扫描变量没设置对。

1.rar

1.98 MB, 下载次数: 3

16

帖子

0

威望

121

eV
积分
137

Level 2 能力者

发表于 2019-8-10 15:45:16 | 显示全部楼层
记得在sob老师文章里提过不推荐用柔性扫描找过渡态,但是如果实在找不到也许可以一试。
柔性扫描是沿着感兴趣的角度和化学键走势能面,走的过程中其它原子的位置都在不断变化以适应新的最低能量结构。而过渡态这种鞍点,很有可能在优化当中落到鞍点的一侧或者另一侧,从而导致即使有过渡态也无法通过柔性扫描准确得到。当然,也有一定概率落在离鞍点比较近的一个稳定结构,以它为初始结构在opt=ts可能能找到过渡态。上面是我的理解,相信没有帮到你,后面的大佬会有高招的。

1万

帖子

25

威望

2万

eV
积分
44706

管理员

公社社长

发表于 2019-8-11 05:58:33 | 显示全部楼层
pcxlm1 发表于 2019-8-10 15:45
记得在sob老师文章里提过不推荐用柔性扫描找过渡态,但是如果实在找不到也许可以一试。
柔性扫描是沿着感 ...

我从没有“不推荐用柔性扫描找过渡态”(本身柔性扫描也根本没法找到过渡态),而是我反对那些明明很容易通过手动摆个初猜就能找到过渡态的场合,某些人非要做一次昂贵的柔性扫描来确定过渡态初猜,甚至有的初学者以为做一次柔性扫描是找过渡态“必经的过程”,不仅多做一步,还造成大量的时间浪费。
自己不好确定过渡态初猜的时候、反复摆都不成功的时候,显然通过柔性扫描帮助确定初猜是很有益的。
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
思想家公社QQ群,1号:18616395,2号:466017436。达5000人,专门交流理论、计算化学。两个群讨论范畴相同,可加入任意其一但不可都加入,申请信息必须注明具体研究方向,否则一概不批。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最流行的量子化学波函数分析程序)

此账号为诸Sobereva共用
Money and papers are rubbish, get a real life!

1万

帖子

25

威望

2万

eV
积分
44706

管理员

公社社长

发表于 2019-8-11 06:10:29 | 显示全部楼层
首先你的计算级别不合适。涉及氢转移的过程应当给氢加上极化函数。确认有没有过渡态应当用更像样的级别,诸如基组用def-TZVP(卟啉部分非重点,仍用6-31G*也可以)

如果用更理想的级别还没过渡态,说明这个过程可能就是没过渡态。毕竟氢转移到OH上的趋势很强,而断裂当前分子的N-H的难度没那么大,造成的能量上升因素可能不够强而导致过渡态出现不了。
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
思想家公社QQ群,1号:18616395,2号:466017436。达5000人,专门交流理论、计算化学。两个群讨论范畴相同,可加入任意其一但不可都加入,申请信息必须注明具体研究方向,否则一概不批。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最流行的量子化学波函数分析程序)

此账号为诸Sobereva共用
Money and papers are rubbish, get a real life!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949-1号 )

GMT+8, 2019-8-21 20:48 , Processed in 0.210451 second(s), 26 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表