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[GROMACS] gromacs算径向分布函数时选择组的问题求助

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这是我用gromacs算点点径向分布函数时出现的情况,为什么会出现这种情况?2、3、4、5为什么会和7、8、9、10是重复的?6又是什么?到5不是就该结束了吗?我哪里弄错了呢?请大神指教。

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发表于 Post on 2019-8-29 21:30:49 | 只看该作者 Only view this author
发帖的时候应看清楚板块再发,求助帖别发到资源分享版里,这在首页的公告栏里已经明确提醒了。给你移动了

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的标题“径向分布函数”改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2019-8-29 21:32:26 | 只看该作者 Only view this author
重复的没事,不用管
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-29 21:35:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-29 21:30
发帖的时候应看清楚板块再发,求助帖别发到资源分享版里,这在首页的公告栏里已经明确提醒了。给你移动了
...

好的,我下次在求助的时候会注意的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-29 21:39:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-29 21:32
重复的没事,不用管

如果我要计算C12和Cl 之间的径向分布函数时该如何选择呢,是选2和3、还是2和8、还是7和8呢?

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发表于 Post on 2019-8-30 03:49:55 | 只看该作者 Only view this author
LuckyLynn 发表于 2019-8-29 21:39
如果我要计算C12和Cl 之间的径向分布函数时该如何选择呢,是选2和3、还是2和8、还是7和8呢?

2和7,3和8应该是完全相同的。你可以试着算一下RDF看一看它们是不是一样

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-30 09:05:00 | 只看该作者 Only view this author
wbn 发表于 2019-8-30 03:49
2和7,3和8应该是完全相同的。你可以试着算一下RDF看一看它们是不是一样

好的谢谢

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