求助SO32-和HOCl反应的柔性扫描问题

Somnus荣小荣 · 发表于 Post on 2019-9-5 16:20:10

老师好，在做一个溶剂化条件下的反应，是SO32-和HOCl反应，推测SO32-直接夺取OH生成HSO4-的过程，一直找不到过渡态，我猜测是否有可能为无垒的过程，我想通过1直接优化可以到产物，2柔性扫描产物生成过程中成键键长随着能量的变化。如果随着成键键长逐渐拉近，能量一直在降低，结合1，确定该过程为无垒过程。请问这样做是否合理呢？如果合理的话在优化和扫描的过程中遇到了一些问题。如图优化过程一：此时O1-S4的距离为1.96唉，直接优化可以到产物，不确定该距离是否合理，会不会太近呢？优化过程二：当O1-S4的距离为2.1唉左右的时候，优化结果发现O1-S4的距离在逐渐拉远。希望扫描O1-S4随着距离拉近能量的变化，但是会出现如下两种情况，扫描过程一：会发生输出文件第一步和输入文件不相符，后续过程是否还有用呢。这样的情况该如何处理呢?多谢各位老师！

sobereva · 发表于 Post on 2019-9-6 00:51:11

直接做个S4-O1的柔性扫描，上传输出文件，比用语言描述得清楚得多

Somnus荣小荣 · 发表于 Post on 2019-9-6 11:17:01

老师，输入输出文件已经上传，忽略我的基组，我也很反感该基组，但是导师指定用这个基组。

Somnus荣小荣 · 发表于 Post on 2019-9-6 11:20:23

tiwen.zip (1017.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

sobereva · 发表于 Post on 2019-9-7 02:28:34

Somnus荣小荣发表于 2019-9-6 11:20

你这个扫描根本没意义啊，步长才0.001，原子位置根本几乎就不动
怎么正确扫描看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

另外，scf=tight完全多余，看
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331（http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html）

Somnus荣小荣 · 发表于 Post on 2019-9-8 15:42:28

sobereva 发表于 2019-9-7 02:28
你这个扫描根本没意义啊，步长才0.001，原子位置根本几乎就不动
怎么正确扫描看
详谈使用Gaussian做势 ...

老师还有一个问题就是，它的输出文件的第一步就已经跟我的输入文件完全不同了，这样的情况继续扫描下去还正确吗？

sobereva · 发表于 Post on 2019-9-9 06:42:07

Somnus荣小荣发表于 2019-9-8 15:42
老师还有一个问题就是，它的输出文件的第一步就已经跟我的输入文件完全不同了，这样的情况继续扫描下去 ...

看不懂。
倘若结构不变，扫描还有什么意义？

Somnus荣小荣 · 发表于 Post on 2019-9-9 09:18:17

sobereva 发表于 2019-9-9 06:42
看不懂。
倘若结构不变，扫描还有什么意义？

好的，明白了，多谢您。

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