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[Gaussian/gview] 过渡态正常收敛,有一个虚频且振动模式正确,但IRC有问题

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各位老师,我最近对一个过渡态进行irc计算,参考sob老师的博文,通过调整关键词,但发现IRC总是跑不对,请问是不是过渡态是有问题的,需要重新优化。我试了以下几种情况:
①我优化的过渡态对应的是一个氢转移反应,虚频-500左右,优化过渡态的关键词是:# M062X/6-311G(d,p)  opt(calcall,ts,noeigen,maxstep=3,notrust)  freq   scrf=smd  int=ultrafine,跑irc的关键词是:# M062X/6-311G(d,p) irc(calcall,maxpoint=20,stepsize=5)   int=ultrafine  scrf=smd  guess=read,得到IRC图形为: ,左边端点是和预期一样的反应物的结构,右边端点也接近于产物的结构,但irc图中靠近过渡态的几个点转折太大了,所以我接下来调整步长试了一下。
②跑irc的关键词是:# M062X/6-311G(d,p) irc(calcall,maxpoint=20,stepsize=3)  int=ultrafine  scrf=smd  guess=read,得到的IRC图形为: ,看irc走的趋势是对的,是氢原子从反应物向产物运动。但因为两端结构离反应物和产物的结构相差太远,我又把步长和步数调整了一下。
③跑irc的关键词是:# M062X/6-311G(d,p) irc(calcfc,maxpoint=50,stepsize=10,LQA)   int=ultrafine  scrf=smd  guess=read,总共跑了101个点,步长调到了10,得到的IRC图形为: ,左边端点结构是想要的反应物结构,右边最开始几步是往产物的方向跑的,但是最后几步就开始向反应物方向跑了。
现在就很疑惑,为什么把步长或者步数变大,IRC结构就变得特别奇怪。这是不是因为我这个过渡态不准确导致的?我是不是要重新优化过渡态呢?望各位大佬不吝赐教。(注:在IRC任务中加guess=read关键词是因为不加的时候IRC任务第一次输出的SCF Done能量和找过渡态最后一步的SCF Done能量明显不同)

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发表于 Post on 2019-9-12 22:31:17 | 只看该作者 Only view this author
你第二次的计算结果挺好,需要的话增加步数就可以了。
为什么要改成第三次那样改算法加步长呢?

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发表于 Post on 2019-9-13 06:57:35 | 只看该作者 Only view this author
2的结果就是对的,增加步数让两边跑长点,自然就像你要的反应物和产物了(除非漏了中间体)

1和3八成都是因为步长还不够小,导致TS旁边的点的波函数没收敛到对应TS的状态,引起势能面突变。要么你也可以尝试把forward和reverse分别跑每次都用guess=read
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发表于 Post on 2019-9-13 08:01:48 | 只看该作者 Only view this author
请问如果步长如此影响irc曲线,那怎么确定得到irc是正确的呢?我的irc跑完后反应物与过渡态能量很相近,请问是怎么回事呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-13 11:22:49 | 只看该作者 Only view this author
Jasminer 发表于 2019-9-12 22:31
你第二次的计算结果挺好,需要的话增加步数就可以了。
为什么要改成第三次那样改算法加步长呢?

好的,谢谢老师,我把步数增加到maxpoint=50试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-13 11:25:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-13 06:57
2的结果就是对的,增加步数让两边跑长点,自然就像你要的反应物和产物了(除非漏了中间体)

1和3八成都 ...

好的,谢谢sob老师,我现在把关键词设为# M062X/6-311G(d,p) irc(calcfc,maxpoint=30,stepsize=5,forward)   int=ultrafine  scrf=smd  guess=read 试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-13 11:26:29 | 只看该作者 Only view this author
最爱喵星人 发表于 2019-9-13 08:01
请问如果步长如此影响irc曲线,那怎么确定得到irc是正确的呢?我的irc跑完后反应物与过渡态能量很相近,请 ...

我也不知道呢,抱歉哈

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-13 12:56:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-13 06:57
2的结果就是对的,增加步数让两边跑长点,自然就像你要的反应物和产物了(除非漏了中间体)

1和3八成都 ...

sob老师,我还想请教一个问题,就是我想对这个过渡态进行单点能计算,是不是也应该加上guess=read呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-13 16:54:57 | 只看该作者 Only view this author
wyy015020 发表于 2019-9-13 12:56
sob老师,我还想请教一个问题,就是我想对这个过渡态进行单点能计算,是不是也应该加上guess=read呢?

我试了一下直接把过渡态的log文件保存成单点能的输入文件,不加guess=read和加guess=read关键词,这个过渡态的单点能差了13kcal/mol

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发表于 Post on 2019-9-13 21:41:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-13 06:57
2的结果就是对的,增加步数让两边跑长点,自然就像你要的反应物和产物了(除非漏了中间体)

1和3八成都 ...

请问如果步长如此影响irc曲线,那怎么确定得到irc是正确的呢?我的irc跑完后反应物与过渡态能量很相近,请问是怎么回事呢?

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发表于 Post on 2019-9-15 11:50:00 | 只看该作者 Only view this author
最爱喵星人 发表于 2019-9-13 21:41
请问如果步长如此影响irc曲线,那怎么确定得到irc是正确的呢?我的irc跑完后反应物与过渡态能量很相近, ...

相关问题在此文里解释得很清楚
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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