Ubuntu 18.04.3 LTS上编译openmpi的问题

biogon · 发表于 Post on 2019-9-22 23:02:23

在Ubuntu 18.04.3 LTS上编译openmpi3.1.3版本按社长博文所述方法都能正常编译，configure和编译过程都没有错误提示，按博文配置了bashrc以后输入mpiexec -v命令提示
Command 'mpiexec' not found, but can be installed with:

apt install lam-runtime
apt install mpich
apt install openmpi-bin
apt install slurm-wlm-torque

Ask your administrator to install one of them.
下面是我在bashrc里面配置的内容
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/QCXA/openmpi313/lib
export PATH=$PATH:/home/QCXA/openmpi313/bin

zjxitcc · 发表于 Post on 2019-9-23 00:34:22

检查看/home/QCXA/openmpi313/bin有没写错、该目录下有无mpiexec等可执行程序。

biogon · 发表于 Post on 2019-9-23 08:31:14

zjxitcc 发表于 2019-9-23 00:34
检查看/home/QCXA/openmpi313/bin有没写错、该目录下有无mpiexec等可执行程序。

你这一说我仔细看了那文件夹不知道为什么就缺了好多东西

zjxitcc · 发表于 Post on 2019-9-23 09:16:40

biogon 发表于 2019-9-23 08:31
你这一说我仔细看了那文件夹不知道为什么就缺了好多东西

少数时候会发生。make distclean后重装一遍即可，建议configure之后先make，然后再make install（如果还不行，make时候不要-j几并行编译）

biogon · 发表于 Post on 2019-9-23 09:38:04

本帖最后由 biogon 于 2019-9-23 09:43 编辑

zjxitcc 发表于 2019-9-23 09:16
少数时候会发生。make distclean后重装一遍即可，建议configure之后先make，然后再make install（如果还 ...

我发现是装到根目录了，难怪找不到问题所在

biogon · 发表于 Post on 2019-9-23 10:03:50

zjxitcc 发表于 2019-9-23 09:16
少数时候会发生。make distclean后重装一遍即可，建议configure之后先make，然后再make install（如果还 ...

装好了东西就在里面，但是执行命令还是有问题

zjxitcc · 发表于 Post on 2019-9-23 14:27:28

biogon 发表于 2019-9-23 09:38
我发现是装到根目录了，难怪找不到问题所在

./configure不加prefix就会装到根目录里，此时若是普通用户，会显示权限不够；若是root用户则会直接装进根目录。如果你想装在普通用户/个人目录下，应该用./configure --prefix=个人路径

biogon · 发表于 Post on 2019-9-23 14:50:45

zjxitcc 发表于 2019-9-23 14:27
./configure不加prefix就会装到根目录里，此时若是普通用户，会显示权限不够；若是root用户则会直接装进 ...

我没加prefix后面没加home就装到根目录去了，现在装好能并行了，但是mpiexec-v没反应

zjxitcc · 发表于 Post on 2019-9-23 15:04:30

本帖最后由 zjxitcc 于 2019-9-23 15:08 编辑

biogon 发表于 2019-9-23 14:50
我没加prefix后面没加home就装到根目录去了，现在装好能并行了，但是mpiexec-v没反应

openmpi查看版本应该是mpiexec -V大写的V

如果不行，再检查一下export的openmpi路径对不对。

biogon · 发表于 Post on 2019-9-23 16:20:29

zjxitcc 发表于 2019-9-23 15:04
openmpi查看版本应该是mpiexec -V大写的V

如果不行，再检查一下export的openmpi路径对不对。

不过倒是orca能正常并行

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