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[NBO相关] 求助:关于不同体系的NBO轨道作用的疑问

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发表于 2019-10-8 02:23:42 | 显示全部楼层 |阅读模式
请问sob老师,我在计算两个体系 HCN和Ph-CN分别与另一个分子中的P作用,两个体系的作用能分别为 17和 27kcal/mol。

在进行NBO分析(NBO6)时发现,两者的轨道作用能差别很大,其中两个体系中较大的轨道作用能如下:

HCN:
  18. LP ( 1) N  5            30. BD*( 2) P  1- O  3     20.85    0.91   0.123
18. LP ( 1) N  5            32. BD*( 2) P  1- O  4     20.82    0.91   0.123

Ph-CN:
   19. LP ( 1) N 12            53. LV ( 1) P 16          169.20    0.49   0.258
   19. LP ( 1) N 12            74. BD*( 1) P 16- O 18      3.98    0.93   0.054
   19. LP ( 1) N 12            75. BD*( 1) P 16- O 19      3.98    0.93   0.054

请问老师:
1-为什么HCN这个体系中NBO输出文件直接没有找到LV(P)这种轨道?
2-两个体系NBO差别这么大,可能是什么原因造成的?是NBO分析结果不准确吗?
非常感谢老师。


附件是NBO6进行NBO分析的输出文件。

Ph-CN.out

222.82 KB, 阅读权限: 120, 下载次数: 1

Ph-CN

HCN.out

103.04 KB, 阅读权限: 120, 下载次数: 1

HCN

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发表于 2019-10-8 07:19:03 | 显示全部楼层
看不到你的结构没法判断
对于弱相互作用范畴,靠NBO判断基本没有意义
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 楼主| 发表于 2019-10-8 15:57:36 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-10-8 07:19
看不到你的结构没法判断
对于弱相互作用范畴,靠NBO判断基本没有意义

非常感谢老师的回复。
我在计算两个体系的时候,发现NBO分析时这两个体系差别较大,不清楚是什么原因造成的。所以想咨询一下老师,大概是什么原因,为什么HCN体系没有LV(P)的轨道作用。

附件是两个体系的构型,因为优化后的构型log文件比较大上传不了,上传的是优化后计算单点能的输出文件。麻烦老师看一下。谢谢!

HCN.log

33.59 KB, 阅读权限: 120, 下载次数: 1

HCN

Ph-CN.log

51.84 KB, 阅读权限: 120, 下载次数: 1

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发表于 2019-10-10 00:46:43 | 显示全部楼层
我在你的另一个帖子里已经说了你这样用B2PLYP波函数是错的,先把这个问题修正了再说
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 楼主| 发表于 2019-10-16 00:20:12 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-10-10 00:46
我在你的另一个帖子里已经说了你这样用B2PLYP波函数是错的,先把这个问题修正了再说

谢谢老师的回复。

您在我之前的帖子里回复我,如果使用B3LYP-D3/6-311+g**水平上获得的波函数进行ELF分析时可以的。我对体系进行NBO分析也是在此水平上获得的波函数进行分析的,B2PLYP-D3方法只是用来获得结合能和作用能信息用的。

请问老师,两个体系的具有较大NBO轨道作用的两个轨道之间相差较大可能是什么原因造成的。我应该在什么角度分析比较合适?谢谢老师!

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发表于 2019-10-16 00:27:31 | 显示全部楼层
suosuosky 发表于 2019-10-16 00:20
谢谢老师的回复。

您在我之前的帖子里回复我,如果使用B3LYP-D3/6-311+g**水平上获得的波函数进行ELF ...

NBO轨道搜索方式存在极大的任意性,其算法很不优雅,有时几何或电子结构特征稍微变化一点就导致判断出的NBO轨道显著不同,所以不要太把NBO的E2当回事,特别是模棱两可的时候
到底输出的有没有意义,用Multiwfn看一下轨道图形进行判断。不要NBO输出什么,就想办法对其予以解释,很可能输出的数据本来就是缺乏化学意义的。
对于弱相互范畴的作用,我是极力不建议拿NBO分析说事的
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