求助Material studio粗粒化模拟建环状模型方法

weirdo · 发表于 Post on 2019-10-9 12:39:26

如题，想请教各位用MS如何做出一个闭环的粗粒化模型？？
我需要把三个或四个柱子连成一个环而不是线性连接
请问需要怎么操作？？？？？

xjp1127721434 · 发表于 Post on 2019-10-18 20:01:53

先用碳原子建个环，然后对每个原子粗粒化。得到你想要的环形粗粒化模型，然后把模型上的珠子换了就行。

星空DMU · 发表于 Post on 2019-11-1 09:16:11

xjp1127721434 发表于 2019-10-18 20:01
先用碳原子建个环，然后对每个原子粗粒化。得到你想要的环形粗粒化模型，然后把模型上的珠子换了就行。

请问怎么把每个原子粗粒化，怎么换珠子，

huangjin · 发表于 Post on 2020-4-2 12:42:04

你先把你要粗粒化的分子画出来，然后用Coarse Grain中的motion groups自己设定需要划为一个粗粒化珠子的原子，然后生成粗粒化分子

lisa25496 · 发表于 Post on 2020-4-9 17:41:37

huangjin 发表于 2020-4-2 12:42
你先把你要粗粒化的分子画出来，然后用Coarse Grain中的motion groups自己设定需要划为一个粗粒化珠子的原 ...

你好请问如果要对网状结构进行粗粒化时有部分原子会共用这该怎么办

张浩东 · 发表于 Post on 2020-7-21 08:09:28

谢谢

huangjin · 发表于 Post on 2020-8-16 08:37:02

lisa25496 发表于 2020-4-9 17:41
你好请问如果要对网状结构进行粗粒化时有部分原子会共用这该怎么办

把共用的原子划分到其中一个粗粒化珠子中，另一个粗粒化珠子就不使用这个共用原子

lisa25496 · 发表于 Post on 2020-9-22 09:41:42

huangjin 发表于 2020-8-16 08:37
把共用的原子划分到其中一个粗粒化珠子中，另一个粗粒化珠子就不使用这个共用原子

好的谢谢

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