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[综合交流] 什么情况下应该在溶剂下优化?

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发表于 5 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位老师大家好,我想请问一下对于有机反应中间体和过渡态的优化过程中,需不需要加溶剂模型,我以前是经常在气象下做结构优化,然后将log文件保存做单点能,但是最经老是被审稿人问到没有加溶剂模型,我听说尤其是高极性溶剂最好考虑到溶剂模型,还是说不论高极性溶剂还是低极性溶剂我们都必须加溶剂模型处理。

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发表于 5 天前 | 显示全部楼层
一般认为多数情况下气相和溶液相的结构相差不大,加之隐式溶剂化模型是对于气相结构拟合的,因此以气相结构做单点和溶剂化自由能计算是合理的。此外隐式溶剂化有时会导致势能面带褶皱,增加优化收敛的困难。
如果认为气相和溶液下结构相差明显(如高电荷/明显电荷分离/...)则有必要加溶剂化优化。

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发表于 5 天前 | 显示全部楼层
极性溶剂下而且溶质某些局部带显著电荷/局部呈离子性时才必须要在溶剂模型下优化
由于隐式溶剂模型造成耗时增加不多,除非有特殊原因,否则一般建议总在溶剂模型下优化,省得审稿人叽叽歪歪
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 楼主| 发表于 5 天前 | 显示全部楼层
Accelerator 发表于 2019-10-9 16:44
一般认为多数情况下气相和溶液相的结构相差不大,加之隐式溶剂化模型是对于气相结构拟合的,因此以气相结构 ...

谢谢

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 楼主| 发表于 5 天前 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-10-9 22:44
极性溶剂下而且溶质某些局部带显著电荷/局部呈离子性时才必须要在溶剂模型下优化
由于隐式溶剂模型造成耗 ...

谢谢sobereva老师
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