计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7651|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[分子对接] 求助:在用autodock-vina操作时只出来两个结果是为什么?

[复制链接 Copy URL]

33

帖子

0

威望

121

eV
积分
154

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位大神,我刚刚接触分子对接 我想请教一下 我做例子的时候vinac出现10个对接出来的结果,做自己的配体-蛋白对接的时候为什么只出现2个对接结果。是因为已经对接成功了,还是说我设置的盒子的距离不够?请求赐教

vina.png (12.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

vina.png

33

帖子

0

威望

121

eV
积分
154

Level 3 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-17 20:16:53 | 只看该作者 Only view this author
我又重新把盒子设置大了一些 可现在只出现一个结果

微信图片_20191017201539.png (63.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 43)

微信图片_20191017201539.png

33

帖子

0

威望

121

eV
积分
154

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-18 08:40:30 | 只看该作者 Only view this author
我想问一下是不是盒子设置的问题才导致这样的结果?

54

帖子

0

威望

887

eV
积分
941

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2024-5-28 11:35:41 | 只看该作者 Only view this author
请问后面解决了吗 什么原因呢

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

5#
发表于 Post on 2024-5-29 13:55:12 | 只看该作者 Only view this author
vina会把rmsd小于9A且打分差别小于3kcal/mol的合并,可以把—minrmsd后面的数值改小比如2

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 02:58 , Processed in 0.288461 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list