Gaussview如何快速构建已知手性分子对应的镜像分子

Shine剪水 · 发表于 Post on 2019-10-24 20:00:59

如题，题主在做结构优化过程前通过Gaussview6的GMMX功能搜索了最优构象，优化后发现其与原晶体结构呈手性对应关系（初猜就已经成手性对应关系了），并且直接取晶体结构作为初猜的优化结果的能量较通过GMMX功能获得的手性对应结构高3kcal/mol左右，故而想通过已获得的呈手性对应的GMMX功能搜索后优化得到的构象构建其手性对应题，不知各位有什么好的办法~

happyknighthawk · 发表于 Post on 2019-10-24 21:33:40

我至少读了三遍你的问题，才（似乎）明白了你要问啥，你是要通过一个分子的构象快速构建它的对映体？用Chem3D可以

Shine剪水 · 发表于 Post on 2019-10-25 09:22:57

happyknighthawk 发表于 2019-10-24 21:33
我至少读了三遍你的问题，才（似乎）明白了你要问啥，你是要通过一个分子的构象快速构建它的对映体？用Chem ...

多谢，问题表述本来想更清楚的，结果啰嗦了

Shine剪水 · 发表于 Post on 2019-10-25 10:33:55

自问自答一下，gview的Edit下拉菜单最后一个选项~

pengyizhou1101 · 发表于 Post on 2020-5-2 11:16:59

我想问一下，我用的Gaussview6.0.16用GMMX做构象搜索的时候，发现根据无法submit，这个键是灰的，是怎么一回事呢？

冰释之川 · 发表于 Post on 2020-5-2 11:26:24

pengyizhou1101 发表于 2020-5-2 11:16
我想问一下，我用的Gaussview6.0.16用GMMX做构象搜索的时候，发现根据无法submit，这个键是灰的，是怎么一 ...

你买了gmmx模块了？没买的话没法使用

Shine剪水 · 发表于 Post on 2020-5-2 20:48:03

冰老师正解，如果购买了gmmx模块，按照正确的安装顺序就可以使用Gaussview6进行构象搜索

pengyizhou1101 · 发表于 Post on 2020-5-17 14:26:20

Shine剪水发表于 2020-5-2 20:48
冰老师正解，如果购买了gmmx模块，按照正确的安装顺序就可以使用Gaussview6进行构象搜索

谢谢提醒

lanthanum · 发表于 Post on 2020-8-27 22:28:04

发现GMMX做构象搜索时，双键都按单键处理，还给自动加上氢，是bug吗？

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-28 04:30:50

用molclus做构象搜索好得多，不要钱、灵活得多，还能做到高得多的精度，还没有帖子里提到的问题。相比之下毫无使用GMMX的必要
详见http://www.keinsci.com/research/molclus.html

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