计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 26424|回复 Reply: 13
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] QST2方法寻找过渡态出现l9999.exe

[复制链接 Copy URL]

66

帖子

0

威望

190

eV
积分
256

Level 3 能力者

RT,我正在使用QST2方法寻找过渡态,现出现了l9999.exe错误。输入文件如下:#p b3lyp/6-31g* fopt(qst2,maxcyc=800) iop(5/13=1) iop(2/16=1) iop(1/11=1) freq



输出文件最后几行如下:
Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**3):
XXXX=          -6347.5856 YYYY=          -1327.2480 ZZZZ=           -514.2104 XXXY=              2.7877
XXXZ=             40.4207 YYYX=            -53.7467 YYYZ=             17.9651 ZZZX=             26.9504
ZZZY=             -0.9658 XXYY=          -1255.3903 XXZZ=          -1291.3123 YYZZ=           -320.5586
XXYZ=              2.5513 YYXZ=             13.3472 ZZXY=             -5.7214
N-N= 1.516128350120D+03 E-N=-5.068417167781D+03  KE= 8.693373371463D+02
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants.
Leave Link  601 at Sat Aug  1 09:36:25 2015, MaxMem=  786432000 cpu:       1.2
(Enter /home/yysheng/software/g09/l9999.exe)


NO MATTER HOW THIN YOU SLICE IT, IT'S STILL BALONEY

                                   -- ALFRED E. SMITH
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in /home/yysheng/software/g09/l9999.exe at Sat Aug  1 09:36:25 2015.
Job cpu time:  0 days  1 hours 13 minutes 44.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    132 Int=      0 D2E=      0 Chk=     10 Scr=      2
"1ts2C_qst2.log" 9012L, 566800C                                                                                            9012,2        Bot


之前以为是maxcyc值设置小了,输入文件里面的maxcyc的值一开始设置为150的,然后修改为了500和800,还是出现同样了的问题。我是菜鸟,没招了,请教高手帮忙解答,谢谢!

293

帖子

8

威望

1694

eV
积分
2147

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2015-8-1 22:55:13 | 只看该作者 Only view this author
試試 opt=noeigentest

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112499

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2015-8-2 01:21:01 | 只看该作者 Only view this author
几乎一定是没收敛。增大maxcyc是白费功夫,只会浪费计算量。

解决方法此文有讨论,虽然讨论的是几何优化的,但大多数对于过渡态搜索同样管用
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

这些关键词别写:iop(5/13=1) iop(2/16=1) iop(1/11=1) maxcyc=800
1/11=1等价于noeigen,凡是有现成关键词的都不要以iop来写
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

66

帖子

0

威望

190

eV
积分
256

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-3 20:09:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-2 01:21
几乎一定是没收敛。增大maxcyc是白费功夫,只会浪费计算量。

解决方法此文有讨论,虽然讨论的是几何优化 ...

谢谢Sob老师给推荐的文章,可是作为一个菜鸟,没怎么看懂,只能根据文章最后一段的方法解决问题:
具体怎么解决优化不收敛得看实际情况,特别是要用gview检查优化过程的轨迹,是否最后开始震荡了。虽然上面讨论了很多,但从实用性出发,对于初学者笔者推荐按照以下顺序去尝试解决震荡问题,如下:
1 对于DFT,特别是明尼苏达系列泛函(如M062X、M06、M06L),首先加上int=ultrafine再试。
2 如果体系小,尝试opt=calcall。如果体系大算得慢,此关键词会令计算量进一步激增,实在没辙再考虑这个。
3 尝试opt=gdiis。
4 尝试opt(gdiis,maxstep=x,notrust),x为3~5。
5 如果上述做法都不灵,干脆改成loose收敛限,但如果之后做振动分析容易有虚频。


这五条都尝试了,尝试3和4建议运行不久就终止了,1,2和5可以正常运行可是结果跟之前的一样,如输入文件:#p b3lyp/6-31g* fopt(qst2,verytight) freq

输出文件最后几行:
Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=           -100.3184   YY=           -109.6487   ZZ=           -129.8615
   XY=             -6.1587   XZ=              4.1677   YZ=              2.4977
Traceless Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=             12.9578   YY=              3.6275   ZZ=            -16.5853
   XY=             -6.1587   XZ=              4.1677   YZ=              2.4977
Octapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**2):
  XXX=            -43.9367  YYY=             23.5706  ZZZ=            -19.5324  XYY=             10.1315
  XXY=             -2.7735  XXZ=            -47.0646  XZZ=              0.2170  YZZ=             -3.3515
  YYZ=             -8.6280  XYZ=              0.9601
Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**3):
XXXX=          -6347.5856 YYYY=          -1327.2480 ZZZZ=           -514.2104 XXXY=              2.7877
XXXZ=             40.4207 YYYX=            -53.7467 YYYZ=             17.9651 ZZZX=             26.9504
ZZZY=             -0.9658 XXYY=          -1255.3903 XXZZ=          -1291.3123 YYZZ=           -320.5586
XXYZ=              2.5513 YYXZ=             13.3472 ZZXY=             -5.7214
N-N= 1.516128350121D+03 E-N=-5.068417167782D+03  KE= 8.693373371463D+02
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants.
Leave Link  601 at Tue Aug  4 00:48:52 2015, MaxMem=  786432000 cpu:       1.7
(Enter /home/yysheng/software/g09/l9999.exe)


THE WORLD OF CHEMICAL REACTIONS IS LIKE A STAGE,
ON WHICH SCENE AFTER SCENE IS CEASELESSLY PLAYED.
THE ACTORS ON IT ARE THE ELEMENTS.
   -- CLEMENS WINKLER   BER. 30,13(1897)
(DISCOVERER OF GERMANIUM, FEB 6, 1886)
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in /home/yysheng/software/g09/l9999.exe at Tue Aug  4 00:48:52 2015.
Job cpu time:  0 days  1 hours 54 minutes 37.5 seconds.
Faile lengths (MBytes):  RWF=    132 Int=      0 D2E=      0 Chk=     10 Scr=      2

Sob老师看看出现了什么问题,谢谢!

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2015-8-3 21:49:11 | 只看该作者 Only view this author
ct_2015 发表于 2015-8-3 20:09
谢谢Sob老师给推荐的文章,可是作为一个菜鸟,没怎么看懂,只能根据文章最后一段的方法解决问题:
具体 ...

输出文件往上找,在表Non-Optimized Param之上找到形如:
Optimization stopped.
    -- Wrong number of Negative eigenvalues: Desired=  1 Actual=  0 # Or something else
    -- Flag reset to prevent archiving.
的行s,贴出来。

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2015-8-3 21:50:06 | 只看该作者 Only view this author
ct_2015 发表于 2015-8-3 20:09
谢谢Sob老师给推荐的文章,可是作为一个菜鸟,没怎么看懂,只能根据文章最后一段的方法解决问题:
具体 ...

以及考虑你的反应是不是基元反应,反应物和产物是否已经优化,结构是否合理

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112499

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2015-8-3 23:07:18 | 只看该作者 Only view this author
ct_2015 发表于 2015-8-3 20:09
谢谢Sob老师给推荐的文章,可是作为一个菜鸟,没怎么看懂,只能根据文章最后一段的方法解决问题:
具体 ...


不要停留在:1 出错   2 没出错   这么低级的判断上。
要从原理出发,搞明白每种帮助收敛的做法的原理,而且必须要观看优化过程中结构变化的轨迹、能量/受力的变化曲线,根据实际情况判断怎么处理最合适。

没有万能的解决不收敛的方法!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

66

帖子

0

威望

190

eV
积分
256

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-4 14:05:55 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-8-3 21:49
输出文件往上找,在表Non-Optimized Param之上找到形如:
Optimization stopped.
    -- Wrong number ...

表Non-Optimized Param之上找到如下:
199         D99        0.00318  -0.01522   0.000001000.00000
200         D100      -0.00119  -0.00388   0.000001000.00000
201         D101       0.00298  -0.00971   0.000001000.00000
202         D102      -0.00139   0.00163   0.000001000.00000
RFO could not converge Lambda in  999 iterations.
Linear search not attempted -- option 19 set.
Iteration  1 RMS(Cart)=  0.00000000 RMS(Int)=  0.00000000
Variable       Old X    -DE/DX   Delta X   Delta X   Delta X     New X
                                 (Linear)    (Quad)   (Total)
    R1        2.65563  -0.00052   0.00000   0.00000   0.00000   2.65563
    R2        2.63161   0.00066   0.00000   0.00000   0.00000   2.63161
    R3        2.05123   0.00009   0.00000   0.00000   0.00000   2.05123
    R4        2.63630   0.00068   0.00000   0.00000   0.00000   2.63630
    R5        2.05383  -0.00007   0.00000   0.00000   0.00000   2.05383
    R6        2.64106  -0.00121   0.00000   0.00000   0.00000   2.64106
    R7        2.05049   0.00007   0.00000   0.00000   0.00000   2.05049
    R8        2.66132  -0.00097   0.00000   0.00000   0.00000   2.66132
    R9        2.63967   0.00470   0.00000   0.00000   0.00000   2.63967
   R10        2.63501  -0.00031   0.00000   0.00000   0.00000   2.63501
   R11        2.77485   0.00271   0.00000   0.00000   0.00000   2.77485
   R12        2.05248  -0.00005   0.00000   0.00000   0.00000   2.05248
   R13        2.69215  -0.00886   0.00000   0.00000   0.00000   2.69215
   R14        2.62948  -0.00177   0.00000   0.00000   0.00000   2.62948
   R15        2.85268  -0.00106   0.00000   0.00000   0.00000   2.85268
   R16        2.70983  -0.00155   0.00000   0.00000   0.00000   2.70983
   R17        3.93457  -0.03642   0.00000   0.00000   0.00000   3.93457
   R18        2.30962   0.00284   0.00000   0.00000   0.00000   2.30962
   R19        2.56361   0.00220   0.00000   0.00000   0.00000   2.56361
   R20        2.04844  -0.00029   0.00000   0.00000   0.00000   2.04844
   R21        2.72222  -0.00262   0.00000   0.00000   0.00000   2.72222
   R22        2.04936   0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   2.04936
   R23        2.63365   0.00235   0.00000   0.00000   0.00000   2.63365
   R24        2.72312  -0.00009   0.00000   0.00000   0.00000   2.72312
   R25        2.59991   0.00023   0.00000   0.00000   0.00000   2.59991
   R26        2.69454   0.00084   0.00000   0.00000   0.00000   2.69454
   R27        2.65479   0.00012   0.00000   0.00000   0.00000   2.65479
   R28        2.61155  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   2.61155
   R29        2.64229   0.00015   0.00000   0.00000   0.00000   2.64229
   R30        1.91121   0.00012   0.00000   0.00000   0.00000   1.91121
   R31        2.62380  -0.00010   0.00000   0.00000   0.00000   2.62380
   R32        2.05381  -0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   2.05381
   R33        2.66495   0.00022   0.00000   0.00000   0.00000   2.66495
   R34        2.05286  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   2.05286
   R35        2.62687  -0.00008   0.00000   0.00000   0.00000   2.62687
   R36        2.05302   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   2.05302
   R37        2.05299  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   2.05299
    A1        2.09326   0.00031   0.00000   0.00000   0.00000   2.09326
    A2        2.08908  -0.00012   0.00000   0.00000   0.00000   2.08908
    A3        2.10081  -0.00018   0.00000   0.00000   0.00000   2.10081
    A4        2.13090  -0.00048   0.00000   0.00000   0.00000   2.13090
    A5        2.07997   0.00027   0.00000   0.00000   0.00000   2.07997
    A6        2.07231   0.00020   0.00000   0.00000   0.00000   2.07231
    A7        2.05208  -0.00035   0.00000   0.00000   0.00000   2.05208
    A8        2.10630  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   2.10630
    A9        2.12478   0.00038   0.00000   0.00000   0.00000   2.12478
   A10        2.10594   0.00121   0.00000   0.00000   0.00000   2.10594
   A11        2.25044   0.00037   0.00000   0.00000   0.00000   2.25044
   A12        1.92616  -0.00155   0.00000   0.00000   0.00000   1.92616
   A13        2.11369  -0.00053   0.00000   0.00000   0.00000   2.11369
   A14        1.88516  -0.00077   0.00000   0.00000   0.00000   1.88516
   A15        2.27731   0.00150   0.00000   0.00000   0.00000   2.27731
   A16        2.07010  -0.00016   0.00000   0.00000   0.00000   2.07010
   A17        2.12655  -0.00004   0.00000   0.00000   0.00000   2.12655
   A18        2.08654   0.00020   0.00000   0.00000   0.00000   2.08654
   A19        1.90448   0.00146   0.00000   0.00000   0.00000   1.90448
   A20        2.23411  -0.00251   0.00000   0.00000   0.00000   2.23411
   A21        2.12345   0.00130   0.00000   0.00000   0.00000   2.12345
   A22        1.86430   0.00177   0.00000   0.00000   0.00000   1.86430
   A23        1.98538   0.00101   0.00000   0.00000   0.00000   1.98538
   A24        1.82309  -0.00075   0.00000   0.00000   0.00000   1.82309
   A25        2.14124   0.00108   0.00000   0.00000   0.00000   2.14124
   A26        1.72009  -0.00485   0.00000   0.00000   0.00000   1.72009
   A27        1.88714   0.00052   0.00000   0.00000   0.00000   1.88714
   A28        1.82258  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   1.82258
   A29        2.27187  -0.00140   0.00000   0.00000   0.00000   2.27187
   A30        2.18553   0.00186   0.00000   0.00000   0.00000   2.18553
   A31        2.10565   0.00022   0.00000   0.00000   0.00000   2.10565
   A32        2.02280   0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   2.02280
   A33        2.15325  -0.00020   0.00000   0.00000   0.00000   2.15325
   A34        2.07608  -0.00071   0.00000   0.00000   0.00000   2.07608
   A35        2.08713   0.00016   0.00000   0.00000   0.00000   2.08713
   A36        2.11866   0.00062   0.00000   0.00000   0.00000   2.11866
   A37        2.07178  -0.00138   0.00000   0.00000   0.00000   2.07178
   A38        2.33123   0.00162   0.00000   0.00000   0.00000   2.33123
   A39        1.85565  -0.00007   0.00000   0.00000   0.00000   1.85565
   A40        2.12774   0.00039   0.00000   0.00000   0.00000   2.12774
   A41        2.18042   0.00148   0.00000   0.00000   0.00000   2.18042
   A42        1.91857  -0.00016   0.00000   0.00000   0.00000   1.91857
   A43        1.86070   0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   1.86070
   A44        2.34466  -0.00008   0.00000   0.00000   0.00000   2.34466
   A45        2.07743   0.00009   0.00000   0.00000   0.00000   2.07743
   A46        1.88627   0.00041   0.00000   0.00000   0.00000   1.88627
   A47        2.12937  -0.00022   0.00000   0.00000   0.00000   2.12937
   A48        2.26755  -0.00019   0.00000   0.00000   0.00000   2.26755
   A49        1.89850   0.00018   0.00000   0.00000   0.00000   1.89850
   A50        2.14999  -0.00035   0.00000   0.00000   0.00000   2.14999
   A51        2.23466   0.00016   0.00000   0.00000   0.00000   2.23466
   A52        2.07764  -0.00007   0.00000   0.00000   0.00000   2.07764
   A53        2.10303  -0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   2.10303
   A54        2.10251   0.00009   0.00000   0.00000   0.00000   2.10251
   A55        2.11205   0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   2.11205
   A56        2.08866   0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   2.08866
   A57        2.08247  -0.00006   0.00000   0.00000   0.00000   2.08247
   A58        2.11812   0.00022   0.00000   0.00000   0.00000   2.11812
   A59        2.08346  -0.00011   0.00000   0.00000   0.00000   2.08346
   A60        2.08161  -0.00011   0.00000   0.00000   0.00000   2.08161
   A61        2.05168  -0.00004   0.00000   0.00000   0.00000   2.05168
   A62        2.11516   0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   2.11516
   A63        2.11634   0.00002   0.00000   0.00000   0.00000   2.11634
    D1       -0.00573   0.00014   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00573
    D2        3.13080   0.00007   0.00000   0.00000   0.00000   3.13080
    D3       -3.13932  -0.00013   0.00000   0.00000   0.00000  -3.13932
    D4       -0.00279  -0.00020   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00279
    D5        0.02500  -0.00020   0.00000   0.00000   0.00000   0.02500
    D6       -3.11589  -0.00067   0.00000   0.00000   0.00000  -3.11589
    D7       -3.12465   0.00006   0.00000   0.00000   0.00000  -3.12465
    D8        0.01764  -0.00041   0.00000   0.00000   0.00000   0.01764
    D9       -0.00650   0.00016   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00650
   D10        3.12778  -0.00029   0.00000   0.00000   0.00000   3.12778
   D11        3.14014   0.00023   0.00000   0.00000   0.00000   3.14014
   D12       -0.00877  -0.00022   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00877
   D13       -0.00086  -0.00039   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00086
   D14       -3.09985  -0.00145   0.00000   0.00000   0.00000  -3.09985
   D15       -3.13505   0.00007   0.00000   0.00000   0.00000  -3.13505
   D16        0.04914  -0.00099   0.00000   0.00000   0.00000   0.04914
   D17        0.02072   0.00034   0.00000   0.00000   0.00000   0.02072
   D18        3.04785   0.00204   0.00000   0.00000   0.00000   3.04785
   D19        3.12698   0.00124   0.00000   0.00000   0.00000   3.12698
   D20       -0.12909   0.00295   0.00000   0.00000   0.00000  -0.12909
   D21        3.10824   0.00061   0.00000   0.00000   0.00000   3.10824
   D22       -0.25291   0.00220   0.00000   0.00000   0.00000  -0.25291
   D23        0.00573  -0.00041   0.00000   0.00000   0.00000   0.00573
   D24        2.92776   0.00119   0.00000   0.00000   0.00000   2.92776
   D25       -0.03257  -0.00001   0.00000   0.00000   0.00000  -0.03257
   D26        3.10834   0.00045   0.00000   0.00000   0.00000   3.10834
   D27       -3.03087  -0.00194   0.00000   0.00000   0.00000  -3.03087
   D28        0.11004  -0.00148   0.00000   0.00000   0.00000   0.11004
   D29        0.19099  -0.00404   0.00000   0.00000   0.00000   0.19099
   D30       -3.03471   0.00162   0.00000   0.00000   0.00000  -3.03471
   D31       -3.07953  -0.00232   0.00000   0.00000   0.00000  -3.07953
   D32       -0.02205   0.00334   0.00000   0.00000   0.00000  -0.02205
   D33        0.11582  -0.00195   0.00000   0.00000   0.00000   0.11582
   D34        2.53370   0.00237   0.00000   0.00000   0.00000   2.53370
   D35       -1.69567   0.00306   0.00000   0.00000   0.00000  -1.69567
   D36       -2.82275  -0.00285   0.00000   0.00000   0.00000  -2.82275
   D37       -0.40487   0.00147   0.00000   0.00000   0.00000  -0.40487
   D38        1.64895   0.00216   0.00000   0.00000   0.00000   1.64895
   D39       -2.66718  -0.00184   0.00000   0.00000   0.00000  -2.66718
   D40        0.53105  -0.00259   0.00000   0.00000   0.00000   0.53105
   D41        0.23021  -0.00014   0.00000   0.00000   0.00000   0.23021
   D42       -2.85475  -0.00089   0.00000   0.00000   0.00000  -2.85475
   D43       -0.18637   0.00353   0.00000   0.00000   0.00000  -0.18637
   D44        3.03388  -0.00157   0.00000   0.00000   0.00000   3.03388
   D45       -2.52403  -0.00129   0.00000   0.00000   0.00000  -2.52403
   D46        0.69623  -0.00638   0.00000   0.00000   0.00000   0.69623
   D47        1.69875   0.00140   0.00000   0.00000   0.00000   1.69875
   D48       -1.36419  -0.00370   0.00000   0.00000   0.00000  -1.36419
   D49        0.26616  -0.00091   0.00000   0.00000   0.00000   0.26616
   D50       -2.48451  -0.00657   0.00000   0.00000   0.00000  -2.48451
   D51        2.55499   0.00450   0.00000   0.00000   0.00000   2.55499
   D52       -0.19568  -0.00116   0.00000   0.00000   0.00000  -0.19568
   D53       -1.75028  -0.00091   0.00000   0.00000   0.00000  -1.75028
   D54        1.78224  -0.00657   0.00000   0.00000   0.00000   1.78224
   D55        0.10503  -0.00151   0.00000   0.00000   0.00000   0.10503
   D56       -3.09102  -0.00012   0.00000   0.00000   0.00000  -3.09102
   D57       -3.09758  -0.00069   0.00000   0.00000   0.00000  -3.09758
   D58       -0.01044   0.00070   0.00000   0.00000   0.00000  -0.01044
   D59       -0.23570   0.00264   0.00000   0.00000   0.00000  -0.23570
   D60        2.63342   0.00349   0.00000   0.00000   0.00000   2.63342
   D61        2.96137   0.00123   0.00000   0.00000   0.00000   2.96137
   D62       -0.45270   0.00209   0.00000   0.00000   0.00000  -0.45270
   D63        0.03882  -0.00071   0.00000   0.00000   0.00000   0.03882
   D64        2.84168   0.00451   0.00000   0.00000   0.00000   2.84168
   D65       -2.89817  -0.00167   0.00000   0.00000   0.00000  -2.89817
   D66       -0.09531   0.00355   0.00000   0.00000   0.00000  -0.09531
   D67       -2.83094  -0.00298   0.00000   0.00000   0.00000  -2.83094
   D68        0.27897  -0.00174   0.00000   0.00000   0.00000   0.27897
   D69        0.06215  -0.00240   0.00000   0.00000   0.00000   0.06215
   D70       -3.11113  -0.00115   0.00000   0.00000   0.00000  -3.11113
   D71        2.88285   0.00176   0.00000   0.00000   0.00000   2.88285
   D72       -0.24981   0.00220   0.00000   0.00000   0.00000  -0.24981
   D73        0.09249  -0.00338   0.00000   0.00000   0.00000   0.09249
   D74       -3.04017  -0.00295   0.00000   0.00000   0.00000  -3.04017
   D75       -0.00809   0.00041   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00809
   D76        3.13118   0.00075   0.00000   0.00000   0.00000   3.13118
   D77       -3.12377  -0.00061   0.00000   0.00000   0.00000  -3.12377
   D78        0.01550  -0.00026   0.00000   0.00000   0.00000   0.01550
   D79       -3.11809  -0.00085   0.00000   0.00000   0.00000  -3.11809
   D80        0.02624  -0.00085   0.00000   0.00000   0.00000   0.02624
   D81       -0.01122   0.00051   0.00000   0.00000   0.00000  -0.01122
   D82        3.13311   0.00051   0.00000   0.00000   0.00000   3.13311
   D83       -0.05051   0.00174   0.00000   0.00000   0.00000  -0.05051
   D84        3.08159   0.00127   0.00000   0.00000   0.00000   3.08159
   D85        3.09365   0.00136   0.00000   0.00000   0.00000   3.09365
   D54        1.78224  -0.00657   0.00000   0.00000   0.00000   1.78224
   D55        0.10503  -0.00151   0.00000   0.00000   0.00000   0.10503
   D56       -3.09102  -0.00012   0.00000   0.00000   0.00000  -3.09102
   D57       -3.09758  -0.00069   0.00000   0.00000   0.00000  -3.09758
   D58       -0.01044   0.00070   0.00000   0.00000   0.00000  -0.01044
   D59       -0.23570   0.00264   0.00000   0.00000   0.00000  -0.23570
   D60        2.63342   0.00349   0.00000   0.00000   0.00000   2.63342
   D61        2.96137   0.00123   0.00000   0.00000   0.00000   2.96137
   D62       -0.45270   0.00209   0.00000   0.00000   0.00000  -0.45270
   D63        0.03882  -0.00071   0.00000   0.00000   0.00000   0.03882
   D64        2.84168   0.00451   0.00000   0.00000   0.00000   2.84168
   D65       -2.89817  -0.00167   0.00000   0.00000   0.00000  -2.89817
   D66       -0.09531   0.00355   0.00000   0.00000   0.00000  -0.09531
   D67       -2.83094  -0.00298   0.00000   0.00000   0.00000  -2.83094
   D68        0.27897  -0.00174   0.00000   0.00000   0.00000   0.27897
   D69        0.06215  -0.00240   0.00000   0.00000   0.00000   0.06215
   D70       -3.11113  -0.00115   0.00000   0.00000   0.00000  -3.11113
   D71        2.88285   0.00176   0.00000   0.00000   0.00000   2.88285
   D72       -0.24981   0.00220   0.00000   0.00000   0.00000  -0.24981
   D73        0.09249  -0.00338   0.00000   0.00000   0.00000   0.09249
   D74       -3.04017  -0.00295   0.00000   0.00000   0.00000  -3.04017
   D75       -0.00809   0.00041   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00809
   D76        3.13118   0.00075   0.00000   0.00000   0.00000   3.13118
   D77       -3.12377  -0.00061   0.00000   0.00000   0.00000  -3.12377
   D78        0.01550  -0.00026   0.00000   0.00000   0.00000   0.01550
   D79       -3.11809  -0.00085   0.00000   0.00000   0.00000  -3.11809
   D80        0.02624  -0.00085   0.00000   0.00000   0.00000   0.02624
   D81       -0.01122   0.00051   0.00000   0.00000   0.00000  -0.01122
   D82        3.13311   0.00051   0.00000   0.00000   0.00000   3.13311
   D83       -0.05051   0.00174   0.00000   0.00000   0.00000  -0.05051
   D84        3.08159   0.00127   0.00000   0.00000   0.00000   3.08159
   D85        3.09365   0.00136   0.00000   0.00000   0.00000   3.09365
   D86       -0.05743   0.00089   0.00000   0.00000   0.00000  -0.05743
   D87       -0.01082  -0.00013   0.00000   0.00000   0.00000  -0.01082
   D88        3.13576  -0.00015   0.00000   0.00000   0.00000   3.13576
   D89        3.12789   0.00030   0.00000   0.00000   0.00000   3.12789
   D90       -0.00871   0.00028   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00871
   D91        0.00308  -0.00037   0.00000   0.00000   0.00000   0.00308
   D92       -3.13741  -0.00014   0.00000   0.00000   0.00000  -3.13741
   D93       -3.14125  -0.00037   0.00000   0.00000   0.00000  -3.14125
   D94        0.00144  -0.00014   0.00000   0.00000   0.00000   0.00144
   D95        0.00154  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   0.00154
   D96       -3.13936   0.00020   0.00000   0.00000   0.00000  -3.13936
   D97       -3.14116  -0.00026   0.00000   0.00000   0.00000  -3.14116
   D98        0.00113  -0.00003   0.00000   0.00000   0.00000   0.00113
   D99        0.00227   0.00028   0.00000   0.00000   0.00000   0.00227
   D100       3.13886   0.00030   0.00000   0.00000   0.00000   3.13886
   D101      -3.14002   0.00005   0.00000   0.00000   0.00000  -3.14002
   D102      -0.00343   0.00007   0.00000   0.00000   0.00000  -0.00343
         Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.036416     0.000002     NO
RMS     Force            0.003107     0.000001     NO
Maximum Displacement     0.000000     0.000006     YES
RMS     Displacement     0.000000     0.000004     YES
Predicted change in Energy=-1.224573D-16
Optimization aborted.
   -- No acceptable step.
                           ----------------------------
                           ! Non-Optimized Parameters !
                           ! (Angstroms and Degrees)  !

老师您看看,谢谢!

66

帖子

0

威望

190

eV
积分
256

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-4 14:18:23 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-8-3 21:50
以及考虑你的反应是不是基元反应,反应物和产物是否已经优化,结构是否合理

反应如图,反应过程不难,应该是基元反应吧,反应物和产物已优化了的。

反应式123.png (15.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 173)

反应式

反应式

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2015-8-4 20:05:46 | 只看该作者 Only view this author
ct_2015 发表于 2015-8-4 14:05
表Non-Optimized Param之上找到如下:
199         D99        0.00318  -0.01522   0.000001000.00000 ...

“结构是否合理”指的是看一下你的过渡态已经变成什么样子了,不是让你把反应式贴出来。我没有遇到过Maximum Displacement是0,然后Gaussian不知道该往哪儿走的情况,不过我猜可能是现在得到的结构已经不合理了,拎出来看一下;如果发现过渡态结构合理,可以直接扔掉反应物和产物的构象,用当前进行不下去的过渡态构象做opt=(ts,calcfc)。(其实我个人一直感觉QST2成功率不高)

66

帖子

0

威望

190

eV
积分
256

Level 3 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-5 14:39:41 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-8-4 20:05
“结构是否合理”指的是看一下你的过渡态已经变成什么样子了,不是让你把反应式贴出来。我没有遇到过Maxi ...

,呵呵,菜鸟菜鸟。按照你的方法我试试,谢谢!

407

帖子

0

威望

856

eV
积分
1263

Level 4 (黑子)

12#
发表于 Post on 2015-8-6 10:51:24 | 只看该作者 Only view this author
学习了

41

帖子

0

威望

829

eV
积分
870

Level 4 (黑子)

13#
发表于 Post on 2015-8-13 17:04:29 | 只看该作者 Only view this author
我认为是你的过渡态结构有点问题,你可以把最后这个结构提取出来,看看是否是你预想的接近,然后稍微调整一下结构参数,用opt=(ts,calcfc)重新优化,或者用qst3方法,并且减小优化步长(用 iop(1/8)来控制,如iop(1/8=5)或者更小iop(1/8=3))。

41

帖子

0

威望

829

eV
积分
870

Level 4 (黑子)

14#
发表于 Post on 2015-8-13 17:09:17 | 只看该作者 Only view this author
需要注意的是,用qst3方法,过渡态和反应物、产物的原子顺序必须一致,有些麻烦。所以用ts方法比较省事,但做完以后必须要用来IRC验证过渡态的准确性。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 12:33 , Processed in 0.813274 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list