计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 16152|回复 Reply: 16
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 怎么优化WB97XD里面的W值?

[复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
The ground-state geometries of the molecules were initially optimized at the B3LYP/cc-pVDZ level of theory. Then, the tuning procedure based on the range-separated (RS) functional (ωB97X) with the cc-pVDZ basis set was performed to obtain the optimal ω values for these geometries; the geometries were then reoptimized using the new ω values.This procedure was iterated until the change in ω became
<10-3 Bohr-1.  

文献上写了步骤我确看不懂
求各位大神帮忙!

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2019-12-3 20:51:09 | 只看该作者 Only view this author
参考卢老师的http://sobereva.com/346

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
sobereva + 2 正解

查看全部评分 View all ratings

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-3 20:56:43 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2019-12-3 20:51
参考卢老师的http://sobereva.com/346。

我不想用这个,用最原始的方法怎么做呢?

368

帖子

0

威望

4693

eV
积分
5061

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2019-12-3 21:47:05 | 只看该作者 Only view this author
Babily777 发表于 2019-12-3 20:56
我不想用这个,用最原始的方法怎么做呢?

不想用别人写好的现成的程序,那就自己写一个,算法是很简单的,你也可以手动一个一个算,不嫌麻烦的话

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125176

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2019-12-4 04:30:06 | 只看该作者 Only view this author
Babily777 发表于 2019-12-3 20:56
我不想用这个,用最原始的方法怎么做呢?

完全意义不明。显然作者是自己写程序实现,要么厚脸皮找作者要程序,要么自己写
如果连文中的描述都尚且看不懂,自己写出程序的可能性为0
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

490

帖子

2

威望

5306

eV
积分
5836

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2019-12-4 08:15:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 让你变成回忆 于 2019-12-5 20:55 编辑

.

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-4 12:40:30 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2019-12-4 08:15
你用sob老师写的这个程序,然后再写一个简单的shell程序就很容易实现了。
文中的意思是先优化结构->在该结 ...

第二步在该结构下优化W怎么实现的呢?WB97XD默认的W是0.2啊,我的命令行输入什么关键字才能改变这个值呢?

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-4 12:47:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-4 04:30
完全意义不明。显然作者是自己写程序实现,要么厚脸皮找作者要程序,要么自己写
如果连文中的描述都尚且 ...

那如果用您写的那个程序,能实现如下操作吗?
an iteration procedure was used to non-empirically tune the ω parameter with the implicit consideration of the dielectric environment via the polarizable continuum model (PCM); the dielectric constant ε was chosen to be 4.0, a representative value of nonpolar organic semiconductor materials.
我的意思是在优化W的时候可以加入介电常数的影响吗?

490

帖子

2

威望

5306

eV
积分
5836

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2019-12-4 13:40:41 | 只看该作者 Only view this author
Babily777 发表于 2019-12-4 12:40
第二步在该结构下优化W怎么实现的呢?WB97XD默认的W是0.2啊,我的命令行输入什么关键字才能改变这个值呢 ...

你仔细读完sob老师上面的那个博文,你就知道怎么设置关键词修改w参数了;
你下面的问题,就是所谓的优化w的过程在PCM下进行,在关键词部分加入对应的溶剂信息即可。

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-4 14:49:30 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2019-12-4 13:40
你仔细读完sob老师上面的那个博文,你就知道怎么设置关键词修改w参数了;
你下面的问题,就是所谓的优化 ...

用IOp 3/107和3/108可以自定义W,但是怎么进行优化呢? 应该是输出文件里给我一个W而不是我自己去定义一个W啊?

490

帖子

2

威望

5306

eV
积分
5836

Level 6 (一方通行)

11#
发表于 Post on 2019-12-4 15:39:58 | 只看该作者 Only view this author
Babily777 发表于 2019-12-4 14:49
用IOp 3/107和3/108可以自定义W,但是怎么进行优化呢? 应该是输出文件里给我一个W而不是我自己去定义一个 ...

你还是去仔细多读几遍上面的博文吧

23

帖子

0

威望

2741

eV
积分
2764

Level 5 (御坂)

12#
发表于 Post on 2019-12-4 18:12:53 | 只看该作者 Only view this author
Babily777 发表于 2019-12-4 14:49
用IOp 3/107和3/108可以自定义W,但是怎么进行优化呢? 应该是输出文件里给我一个W而不是我自己去定义一个 ...

u can u up

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-4 18:31:43 | 只看该作者 Only view this author

还是没弄明白,心塞

23

帖子

0

威望

2741

eV
积分
2764

Level 5 (御坂)

14#
发表于 Post on 2019-12-5 12:05:26 | 只看该作者 Only view this author
Babily777 发表于 2019-12-4 18:31
还是没弄明白,心塞

别人给你的意见你都不做,怎么弄明白。更何况现成的程序你都不用,要人家怎么帮你。难道要人家把所有的数据都处理好,再把文章写好,只等文章接收,挂你为一作吗?伸手党。

14

帖子

0

威望

49

eV
积分
63

Level 2 能力者

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-5 13:39:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Babily777 于 2019-12-5 16:09 编辑
leebo 发表于 2019-12-5 12:05
别人给你的意见你都不做,怎么弄明白。更何况现成的程序你都不用,要人家怎么帮你。难道要人家把所有的数 ...

我做了,也做出来了。现成的程序我不用是因为我担心不符合我的体系。非常感谢您的关心呢!
世界如此美好,你却如此刻薄,何必呢?我吃你家大米了吗?

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
Hyperion + 4 正解

查看全部评分 View all ratings

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 10:52 , Processed in 0.258953 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list