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[新手求助] IRC端点优化络合物形状怎么判断正确与否

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大家好:
  最近在计算戊醇氢提取反应,我通过走IRC来获得络合物,但是取端点优化后遇到问题:
  1:如何判断络合物中弱相互作用的位置
  2:有时候优化结果尽管是反应物,但是自由基的位置比较奇怪,感觉对应的位点不对,怎么办?
  谢谢大家!

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发表于 Post on 2020-1-2 19:33:21 | 只看该作者 Only view this author
走IRC,对末端结构做优化
有的时候IRC路径很长,跑完整的话可能也会看到到了靠后的区域开始出现一些一开始未预料的结构重排。也有可能是你对末端优化的时候没把步长上限设小,导致偶然跑到其它极小点去,或者计算级别不合理等等
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-3 09:12:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jing-quan63 于 2020-1-3 09:15 编辑
sobereva 发表于 2020-1-2 19:33
走IRC,对末端结构做优化
有的时候IRC路径很长,跑完整的话可能也会看到到了靠后的区域开始出现一些一开始 ...

谢谢sob老师,我用的M062X/CC-PVTZ int=ultrafine,进行优化,请问步长怎么设置比较合适? 另外我优化的结构也还是反应物,只是羟基本来提取1号位氢原子,但是优化结果感觉更像提取2号位,产物结构正确,请问这种情况合理么?谢谢老师答疑解惑

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发表于 Post on 2020-1-3 11:52:59 | 只看该作者 Only view this author
jing-quan63 发表于 2020-1-3 09:12
谢谢sob老师,我用的M062X/CC-PVTZ int=ultrafine,进行优化,请问步长怎么设置比较合适? 另外我优化的结 ...

cc-pVTZ给DFT用是非常差的做法,仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

IRC、优化目的都没必要用这么大基组,看
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387http://bbs.keinsci.com/thread-6600-1-1.html

步长上限改小为5,加上notrust

没具体结构说不清楚
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