关于过渡金属有机化合物对映异构体能量问题

明园 · 发表于 Post on 2020-1-8 13:10:07

社长，请问过渡金属有机化合物对映异构体的能量是否应该一致？

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-1-8 13:22:08

是一样的。其实你鼠标点两个中小分子，高斯几分钟就算完了···比发帖、等回复快。

明园 · 发表于 Post on 2020-1-8 15:07:11

可能刚才描述不够明确，例如刚才那张图互为对映异构的两个分子，算同一个反应位点的过渡态，对两个分子用gview手动摆过渡态，过渡态都算出来了，虚频对，IRC也能走到反应物和产物的趋势，但是单点能不一样。
但对其中一个分子的过渡态做gview的镜像对应，得到的另一个分子的过渡态，这时候两个过渡态算出来的单点能一致（过渡态虚频对，IRC也对），请问这种情况如何解释？

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-1-8 15:28:27

明园发表于 2020-1-8 15:07
可能刚才描述不够明确，例如刚才那张图互为对映异构的两个分子，算同一个反应位点的过渡态，对两个分子用gv ...

“手摆”的毕竟与直接镜面对映出来的还是有差别的，应该以镜面对映出来的结构为准。如果你想知道“手摆”的结构与镜面对映出来的结构有啥区别，用VMD计算一下两个结构的RMSD值就知道了，看看两个结构是否有差异（注意原子顺序必须一一对应）。

明园 · 发表于 Post on 2020-1-10 16:40:53

zjxitcc 发表于 2020-1-8 15:28
“手摆”的毕竟与直接镜面对映出来的还是有差别的，应该以镜面对映出来的结构为准。如果你想知道“手摆 ...

好的谢谢您

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