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[Gaussian/gview] fchk文件的转化出错

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发表于 Post on 2015-8-20 10:26:15 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
我想把所有的xxx.chk文件转化成xxx.fchk然后用multiwfn来计算mayer键级和拉普拉斯值等数据,但是输入命令formchk xxx.chk xxx.fchk后发生错误,如下
[rym@mic fchk]$ formchk xxx.chk xxx.fchk
Read checkpoint file TDA-1-i-liq.chk
Write formatted file TDA-1-i-liq.fchk
Missing data for FChkPn.
Error termination via Lnk1e at Thu Aug 20 17:58:30 2015.



形成的.fchk文件大小为0.
请问这是怎么回事
谢谢老师

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发表于 Post on 2015-8-20 12:45:11 | 显示全部楼层 Show all
重新算一下单点重新得到chk再转换看看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-22 09:58:07 来自手机 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2015-8-20 12:45
重新算一下单点重新得到chk再转换看看

谢谢 问题已解决

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发表于 Post on 2022-1-15 16:11:23 | 显示全部楼层 Show all

您好,我遇到了同样的问题,转换的文件只做了opt与freq,按sob老师的方法是不是要算一下单点能?您看跟您遇到的问题一样吗?期待您的回答

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发表于 Post on 2022-3-14 14:50:18 | 显示全部楼层 Show all
王元亮 发表于 2022-1-15 16:11
您好,我遇到了同样的问题,转换的文件只做了opt与freq,按sob老师的方法是不是要算一下单点能?您看跟您 ...

你好,请问你的问题解决了吗?

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发表于 Post on 2022-3-14 15:05:25 | 显示全部楼层 Show all
王元亮 发表于 2022-1-15 16:11
您好,我遇到了同样的问题,转换的文件只做了opt与freq,按sob老师的方法是不是要算一下单点能?您看跟您 ...

正常结束的文件不应该转化失败,首先确认一下计算是否正常结束,如果是正常结束转化失败,检查一下是不是用的不同的系统,Linux下的chk不能在win下转换,win的chk文件也不能在Linux中转换。这些都没问题就重新算一个单点得到chk

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发表于 Post on 2022-3-14 15:06:27 | 显示全部楼层 Show all
yangxuping 发表于 2022-3-14 14:50
你好,请问你的问题解决了吗?

正常结束的文件不应该转化失败,首先确认一下计算是否正常结束,如果是正常结束转化失败,检查一下是不是用的不同的系统,Linux下的chk不能在win下转换,win的chk文件也不能在Linux中转换。这些都没问题就重新算一个单点得到chk

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发表于 Post on 2022-3-18 20:50:56 | 显示全部楼层 Show all
我想知道怎么把fchk文件转化为chk文件,高斯输出结果之后不小心把chk文件删除了

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发表于 Post on 2022-3-18 20:54:16 | 显示全部楼层 Show all
王若曦 发表于 2022-3-18 20:50
我想知道怎么把fchk文件转化为chk文件,高斯输出结果之后不小心把chk文件删除了

unfchk xxx.fchk xxx.chk
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2022-3-18 21:54:19 | 显示全部楼层 Show all
王若曦 发表于 2022-3-18 20:50
我想知道怎么把fchk文件转化为chk文件,高斯输出结果之后不小心把chk文件删除了

有fchk科研不要chk了
可以去回收站找一下

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发表于 Post on 2022-5-10 19:47:45 | 显示全部楼层 Show all
我在转换过程中发现一个问题是在windows系统向虚拟机里复制chk文件的时候经常发生复制的文件的大小远小于原文件的情况,不知道这个是不是我的虚拟机的问题。使用这样的文件去formchk就会报Missing data for FChkPn的错误。正常复制之后再formchk就没有这个问题了,当然需要注意gaussian的版本问题。(仅提出一种出现这个问题的可能)

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发表于 Post on 6 day ago | 显示全部楼层 Show all
UTM 发表于 2022-5-10 19:47
我在转换过程中发现一个问题是在windows系统向虚拟机里复制chk文件的时候经常发生复制的文件的大小远小于原 ...

如果是直接拖,大文件极大概率复制不完整
复制 - 粘贴 方式向虚拟机传大文件成功率高得多,但是碰上几GB的文件也时不时传不完整
通过共享文件夹,或者sftp等方式传文件,100%能传完整
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发表于 Post on 6 day ago | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-5-16 00:08
如果是直接拖,大文件极大概率复制不完整
复制 - 粘贴 方式向虚拟机传大文件成功率高得多,但是碰上几GB ...

哦哦学到了,确实每次拖大文件的时候几乎都不完整,得试好多次才能得到完整的,谢谢sob老师的指点,又学了一招。

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