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[其它程序] Centos7下安装GPAW报错求助

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发表于 2020-2-9 00:28:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
想学习GPAWhttps://wiki.fysik.dtu.dk/gpaw/install.html#

但是Centos7环境下安装
python3 -m pip install gpaw
报错。。。折腾了好久安不上


Running setup.py install for gpaw ... error
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: /usr/local/bin/python3 -u -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-va84ucw1/gpaw/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-va84ucw1/gpaw/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /tmp/pip-record-edh98cpa/install-record.txt --single-version-externally-managed --user --prefix= --compile --install-headers /home/ming/.local/include/python3.7m/gpaw
         cwd: /tmp/pip-install-va84ucw1/gpaw/
    Complete output (895 lines):
    which: no mpicc in (/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/bin:/sbin:/home/ming/.local/bin:/home/ming/bin)
    .git directory not found. GPAW git hash not written.


弄不清楚问题在哪里。。。
求助。。谢谢

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发表于 2020-2-9 02:54:43 | 显示全部楼层
which: no mpicc in (/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/bin:/sbin:/home/ming/.local/bin:/home/ming/bin)

应该是安装程序没找到mpicc。
或者可以试试Customizing installation的方式,然后把siteconfig.py修改成和你服务器环境一致的环境变量。

当时编译的时候倒是还算顺利,但最后做test也不是全都pass的,看看还有没有更有经验的前辈能一块交流交流。
满招损,谦受益。热衷于理论和方法研究水平不高但欢迎讨论。

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发表于 2020-2-9 05:53:53 | 显示全部楼层
帖子标题末尾已经写了“求助”了就不要自己在开头再写【求助】,给你去掉了

看GPAW官网说明有没有提到兼容什么MPI库。诸如兼容OpenMPI,你就安装OpenMPI到默认路径下,然后重新编译再试
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发表于 2020-2-9 11:19:39 | 显示全部楼层
看下GPAW文档的安装部分,需要自己配置一些路径。
17年我编译成功过,但是一直没怎么用。现在看了文档,发现配置方式已经改了,因此我的编译方式对你参考价值不大。

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 楼主| 发表于 2020-2-9 17:59:08 | 显示全部楼层
卡开发发 发表于 2020-2-9 02:54
应该是安装程序没找到mpicc。
或者可以试试Customizing installation的方式,然后把siteconfig.py修改成 ...

谢谢~我这就试试

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 楼主| 发表于 2020-2-9 18:00:51 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2020-2-9 05:53
帖子标题末尾已经写了“求助”了就不要自己在开头再写【求助】,给你去掉了

看GPAW官网说明有没有提到兼 ...

哦哦~好的谢谢

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 楼主| 发表于 2020-2-9 18:01:27 | 显示全部楼层
get-it 发表于 2020-2-9 11:19
看下GPAW文档的安装部分,需要自己配置一些路径。
17年我编译成功过,但是一直没怎么用。现在看了文档,发 ...

谢谢~~我再努力一把。。。
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