Multiwfn拟合静电势非常缓慢

archer · 发表于 Post on 2020-3-6 18:24:18

我的体系有100多原子，运行了6个小时还没有结束。

snljty · 发表于 Post on 2020-3-6 18:39:12

看卢老师的
Multiwfn现已可以调用cubegen使静电势分析耗时有飞跃式的下降！
http://bbs.keinsci.com/thread-10682-1-1.html
今天刚发的
对ORCA用户大幅节约Multiwfn做分子表面静电势分析耗时的方法
http://bbs.keinsci.com/thread-16499-1-1.html
还有
巨大体系的范德华表面静电势图的快速绘制方法
http://bbs.keinsci.com/thread-13140-1-1.html
另外，软件本身的提示也写得很清楚。既然输入文件是fch文件，更应该把settings.ini里面的cubegenpath改成真实的路径。

sobereva · 发表于 Post on 2020-3-7 03:32:19

而且我在几乎所有与Multiwfn做静电势有关的博文里都明确说了借用cubegen能大幅降低耗时，何故不用？

RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）

Multiwfn在计算包括RESP在内的拟合静电势电荷过程中需要基于波函数计算所有拟合点的静电势。Multiwfn自身有计算静电势的代码，计算小体系耗时不太高，但是体系大了的话耗时会比较高。为了降低静电势计算耗时，当你使用.fch作为输入文件时，Multiwfn允许调用Gaussian自带的计算静电势很快的cubegen工具来计算静电势，只要启动Multiwfn前先把settings.ini配置文件里的cubegenpath设为机子里Gaussian目录下cubegen程序的实际路径即可，详见此文的说明：http://sobereva.com/435。对于经常算拟合静电势电荷或者要算较大体系拟合静电势电荷的人，强烈建议这样让Multiwfn调用cubegen计算静电势，耗时可能能降低高达两个数量级。

archer · 发表于 Post on 2020-3-7 10:07:45

sobereva 发表于 2020-3-7 03:32
而且我在几乎所有与Multiwfn做静电势有关的博文里都明确说了借用cubegen能大幅降低耗时，何故不用？

RES ...

明白了，感谢您的回复！

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