请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 238|回复: 9

[Multiwfn资源与经验] python+matplotlib绘制弱相互作用散点图(第二弹)

[复制链接]

2464

帖子

10

威望

5094

eV
积分
7758

Level 6 (一方通行)

首席卖萌官

发表于 2020-3-23 12:15:48 | 显示全部楼层 |阅读模式
第一弹:http://bbs.keinsci.com/thread-12764-1-1.html

先看一下作图的效果:/Multiwfn/examples/2-pyridoxine_2-aminopyridine.wfn


Figure_1.png

Figure_2.png


因为没有并行化,所以作图效率很慢。
如有不明之处,可以站内信或者留言。

脚本:



RDG_scatter.py (942 Bytes, 下载次数: 25)

评分

参与人数 1eV +8 收起 理由
sobereva + 8

查看全部评分

She doesn't love me.
Even so,
my heart has been taken away by her.

235

帖子

1

威望

616

eV
积分
871

Level 4 (黑子)

发表于 2020-3-23 12:49:20 | 显示全部楼层
噗,我之前也拿python写过一个,发在卢老师发在公社里那篇博文的评论区了。mpl不自带bgr色带还真添麻烦。

2464

帖子

10

威望

5094

eV
积分
7758

Level 6 (一方通行)

首席卖萌官

 楼主| 发表于 2020-3-23 15:06:26 | 显示全部楼层
snljty 发表于 2020-3-23 12:49
噗,我之前也拿python写过一个,发在卢老师发在公社里那篇博文的评论区了。mpl不自带bgr色带还真添麻烦。

还是你的方法好一些,我研究研究
She doesn't love me.
Even so,
my heart has been taken away by her.

235

帖子

1

威望

616

eV
积分
871

Level 4 (黑子)

发表于 2020-3-23 18:59:15 | 显示全部楼层
我本是个娃娃 发表于 2020-3-23 15:06
还是你的方法好一些,我研究研究

哈哈谢谢您!我也是翻了半天手册里相关内容,可气的是自带好多好多种色条唯独没有bgr

2464

帖子

10

威望

5094

eV
积分
7758

Level 6 (一方通行)

首席卖萌官

 楼主| 发表于 2020-3-23 19:01:39 | 显示全部楼层
snljty 发表于 2020-3-23 18:59
哈哈谢谢您!我也是翻了半天手册里相关内容,可气的是自带好多好多种色条唯独没有bgr

camp='jet'就是自带的色带,我觉得也不错。
She doesn't love me.
Even so,
my heart has been taken away by her.

235

帖子

1

威望

616

eV
积分
871

Level 4 (黑子)

发表于 2020-3-23 19:07:36 | 显示全部楼层
我本是个娃娃 发表于 2020-3-23 19:01
camp='jet'就是自带的色带,我觉得也不错。

Capture.PNG
说真的我觉得这个更好看,就是感觉和NCI原文的规定不太一样

2770

帖子

27

威望

9537

eV
积分
12847

Level 6 (一方通行)

发表于 2020-3-23 20:30:04 | 显示全部楼层
snljty 发表于 2020-3-23 19:07
说真的我觉得这个更好看,就是感觉和NCI原文的规定不太一样

其实最接近的是rainbow,不过由于这个帖子里提到的问题http://bbs.keinsci.com/thread-15756-1-1.html,RDG的colormap其实不应该是均一的(蓝到绿0.2,绿到红0.4)所以其实必须自己定义。

33

帖子

0

威望

182

eV
积分
215

Level 3 能力者

发表于 2020-3-23 23:08:28 | 显示全部楼层
咦,大神 想问下这代码里的输入文件是什么文件呢?material studio软件中的什么结果可以作为输入文本呢?

2464

帖子

10

威望

5094

eV
积分
7758

Level 6 (一方通行)

首席卖萌官

 楼主| 发表于 2020-3-24 10:56:16 | 显示全部楼层
dmpb 发表于 2020-3-23 23:08
咦,大神 想问下这代码里的输入文件是什么文件呢?material studio软件中的什么结果可以作为输入文本呢?

波函数文件经过multiwfn处理后,导出散点的文本文件所绘制。
MS的结果无法作为绘制的输入文件。
She doesn't love me.
Even so,
my heart has been taken away by her.

33

帖子

0

威望

182

eV
积分
215

Level 3 能力者

发表于 2020-3-25 00:42:43 | 显示全部楼层
我本是个娃娃 发表于 2020-3-24 10:56
波函数文件经过multiwfn处理后,导出散点的文本文件所绘制。
MS的结果无法作为绘制的输入文件。

好的  谢谢您
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949-1号 )

GMT+8, 2020-4-4 23:50 , Processed in 0.159769 second(s), 27 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表