小白求助简正模式的区分（用于拟合力常数）

北京的大猫 · 发表于 Post on 2020-4-20 16:26:48

各位前辈及sob老师好，
本人想通过调整分子力场的力常数（键伸缩，键角弯曲）使得分子力场计算的简正模式的频率和量化计算的频率接近这一方法来构建某一分子的力场，使用了Tinker及Force Field Expolre（FFE）,以及可观看振动模式的量化计算软件，但是在某些频率的振动模式非常相近（量化计算和分子力场计算的结果都分别存在这种情况）
而无法区别，这就导致无法利用FFE将Tinker计算得到的简正模式和量化的结果匹配起来，请问各位前辈有解决办法或者其他方法吗？
另外有的简正模式涉及多个原子的运动比如五元环的振动，单单调整某一力常数无法得到准确的结果，这种情况下该怎么办呢？是不是只能多次尝试？

谢谢大家！Best Wishes!

sobereva · 发表于 Post on 2020-4-20 16:30:46

1 此时需要结合振动模式来进行区分，诸如计算基于MM计算的正则坐标和基于QM计算的正则坐标的重合度判断如何对应

2 显然这种振动模式受多个力场参数影响，不可能光调一个来解决，这相当于是一个多元函数优化问题

北京的大猫 · 发表于 Post on 2020-4-20 17:12:52

sobereva 发表于 2020-4-20 16:30
1 此时需要结合振动模式来进行区分，诸如计算基于MM计算的正则坐标和基于QM计算的正则坐标的重合度判断如何 ...

谢谢sob老师，关于第一点，请问某一振动模式的MM和QM的正则坐标如何计算呀？一般的量化软件有这个功能吗?

sobereva · 发表于 Post on 2020-4-22 04:23:10

北京的大猫发表于 2020-4-20 17:12
谢谢sob老师，关于第一点，请问某一振动模式的MM和QM的正则坐标如何计算呀？一般的量化软件有这个功能吗?

诸如Gaussian做freq任务之后，每个频率值下方的那一串数就是正则坐标

北京的大猫 · 发表于 Post on 2020-4-22 19:29:04

sobereva 发表于 2020-4-22 04:23
诸如Gaussian做freq任务之后，每个频率值下方的那一串数就是正则坐标

恩恩，谢谢sob老师～

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[综合交流] 小白求助简正模式的区分（用于拟合力常数）

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