cp2k7.1安装中遇到的几个问题

wanlichuan

在centos7.6虚拟机上，直接用目录下的 tools/toolchain/install_cp2k_toolchain.sh脚本可自动安装cp2k6.1, 一切正常。但是用同样的方法安装cp2k7.1，出现了如下错误：

==================== Installing ELPA====================

elpa-2019.05.001.tar.gz: OK

Checksum of elpa-2019.05.001.tar.gz Ok

Installing from scratch into /home/cp2k/cp2k-7.1.0/tools/toolchain/install/elpa-2019.05.001

ERROR: (./scripts/install_elpa.sh, line 103)Non-zero exit code detected.

Step ptscotch took 0.00 seconds.

Step parmetis took 0.00 seconds.

Step metis took 0.00 seconds.

Step superlu took 0.00 seconds.

Step pexsi took 0.00 seconds.

Step quip took 0.00 seconds.

Step plumed took 0.00 seconds.

==================== Installing gsl ====================

打开scripts/install_elpa.sh文件的第103行，是这样的：

make -j $NPROCS ${ELPA_MAKEOPTS}>make.log 2>&1

不知道“Non-zero exit code detected”指什么？怎么修改？



后来手动安装elpa，用下面的指令：

1）wgethttp://elpa.mpcdf.mpg.de/html/Re ... -2019.11.001.tar.gz

2）tar xvf elpa-2019.11.001.tar.gz

3）cd elpa-2019.11.001

4）wget --no-check-certificate https://github.com/hfp/xconfigure/raw/master/configure-get.sh

5）chmod +x configure-get.sh

6）./configure-get.sh elpa

在第4步的时候出错，错误信息如下：

--2020-04-2020:49:55-- https://github.com/hfp/xconfigure/raw/master/configure-get.sh

Resolvinggithub.com (github.com)... 13.229.188.59

Connectingto github.com (github.com)|13.229.188.59|:443... connected.

HTTPrequest sent, awaiting response... 302 Found

Location:https://raw.githubusercontent.co ... er/configure-get.sh [following]

--2020-04-2020:49:56-- https://raw.githubusercontent.co ... er/configure-get.sh

Resolvingraw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com)... ::1, 127.0.0.1

Connectingto raw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com)|::1|:443... failed:Connection refused.

Connectingto raw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com)|127.0.0.1|:443...failed: Connection refused.



后来用“./configure + make install”的模式，configure也出错：

configure:error: could not link with blas: specify path



请教高手，上面这些报错都该怎么解？怎么安装elpa呢？
谢谢。

haizhiwuyu

用toolchain脚本编译时，错误信息应当去/tools/toolchain/build/elpa文件下去查看，建议重点排查是不是python 的问题。

wanlichuan

谢谢回复。我查看了一下，在/tools/toolchain/build/中没有一个叫“elpa”的文件夹，只有一个叫“elpa-2019.05.001”的，其下有939个文件。从修改日期上看，只有“obj_no_thread”文件夹的最后修改日期是新的，其他都是2019年修改。这个文件夹下也有491个文件。不知道应该查看哪个文件。请大侠再指点一二。

[img][/img]
谢谢。

wanlichuan

刚才粘帖的图片未显示，重新粘帖一遍。

jiangning198511

感觉是网络原因，是不是没有下载完全，我安装过CP2K7.1,和你的方法一样，没有任何问题

wanlichuan

哦，这倒有可能，我再重新装一遍。谢谢回复。

haizhiwuyu

wanlichuan 发表于 2020-4-21 09:20
谢谢回复。我查看了一下，在/tools/toolchain/build/中没有一个叫“elpa”的文件夹，只有一个叫“elpa-2019 ...

所有的log文件，看错误信息

amani73986

你好，请问这个问题解决了么？我也遇到了一样的问题，重装了几次都不行。谢谢。

wanlichuan

没有。用不同方法重装了几次，也看了看相关文件，一直没找到解决办法。现在还是用6.1版。

wangtaochem

wanlichuan 发表于 2020-5-13 12:01
没有。用不同方法重装了几次，也看了看相关文件，一直没找到解决办法。现在还是用6.1版。

http://bbs.keinsci.com/thread-17324-1-1.html，我在该帖子里上传了cp2k7.1版本脚本编译所需源码包、高版本gcc和build文件，centos 7 gcc编译，亲测可以完成编译。

wanlichuan

wangtaochem 发表于 2020-5-14 10:19
http://bbs.keinsci.com/thread-17324-1-1.html，我在该帖子里上传了cp2k7.1版本脚本编译所需源码包、高 ...

太好了，非常感谢。我试试。

MADAOLay

wanlichuan 发表于 2020-5-14 19:55
太好了，非常感谢。我试试。

您好，请问您最终cp2k编译成功了吗，我现在也出现了Non-zero exit code detected的问题，不知道如何解决

wanlichuan

MADAOLay 发表于 2020-5-23 19:23
您好，请问您最终cp2k编译成功了吗，我现在也出现了Non-zero exit code detected的问题，不知道如何解决
...

没有，按照10楼wangtaochem老师的方法也不行。前面几步都没问题，先安装GCC、openmpi和cmake，都很顺利，但是通过“install_cp2k_toolchain.sh”自动安装的时候还是ELPA失败。手动安装也不行。一直没找到原因所在。

pwzhou

wanlichuan 发表于 2020-5-24 19:12
没有，按照10楼wangtaochem老师的方法也不行。前面几步都没问题，先安装GCC、openmpi和cmake，都很顺利， ...

make.log最后应该有出错信息的。

wanlichuan

pwzhou 发表于 2020-5-24 19:32
make.log最后应该有出错信息的。

谢谢您的回复。也看过这个文件（见附件），里面有很多信息，一头雾水，不知道怎么解决。