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[Gaussian/gview] win版gaussian16的CPU利用率问题求助

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大家好,我这个服务器是双路E5 2680v2,20核心,win系统,用的Gaussian16,我一共开了7个任务,每个任务都分配3核心,可是总共CPU利用率还不到40%,这一看就没有高效运行,求助这怎么破?怎么提高CPU运行效率?谢谢大家!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-24 20:17:57 | 只看该作者 Only view this author
补充一下,6个任务是3核心,一个任务是2核心,一共加起来20

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发表于 Post on 2020-4-24 20:32:22 | 只看该作者 Only view this author
你做DFT计算,还是postHF计算?
如果是后者,请确保运行一个或者两个计算;
如果是前者,做DFT计算,请先修正为偶数核心试试,如果效率没有改善,个人愚见,换用Linux下运行。

Linux下运行,唯一的差别可能在于需要输入 g16 XXX.input.file.YYY & 之类的。
仅供参考。不代表最佳解决方案。(因为我不用win系统,可能推测的原因都是瞎扯蛋)
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发表于 Post on 2020-4-24 20:35:34 | 只看该作者 Only view this author
总共利用率40%是怎么看出来的?建议看看每个核的占用情况

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-24 20:50:21 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-4-24 20:35
总共利用率40%是怎么看出来的?建议看看每个核的占用情况

谢谢回复,图片不会发奥,我简单说一下,CPU总共利用率不到40%,单个核心看的话,有那么几个是利用率接近100%,但是大部分都很低,有的几乎利用率是0

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发表于 Post on 2020-4-24 20:51:17 | 只看该作者 Only view this author
songxiangan 发表于 2020-4-24 20:50
谢谢回复,图片不会发奥,我简单说一下,CPU总共利用率不到40%,单个核心看的话,有那么几个是利用率接近 ...

怎么发图看这个帖子

!!!!!计算化学公社新社员必读!!!!!
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 25&fromuid=5840

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-24 20:52:14 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2020-4-24 20:32
你做DFT计算,还是postHF计算?
如果是后者,请确保运行一个或者两个计算;
如果是前者,做DFT计算,请 ...

谢谢回复,我是算的TD-DFT,我按照你说的试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-24 20:56:36 | 只看该作者 Only view this author

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-24 20:57:17 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2020-4-24 20:51
怎么发图看这个帖子

!!!!!计算化学公社新社员必读!!!!!

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-24 22:00:13 | 只看该作者 Only view this author
刚找到了这个,挺好!
http://sobereva.com/392

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发表于 Post on 2020-4-25 00:58:23 | 只看该作者 Only view this author
songxiangan 发表于 2020-4-24 20:17
补充一下,6个任务是3核心,一个任务是2核心,一共加起来20

以后要补充什么不要单独发帖,直接在原帖里编辑(除非已经有人回复过当前帖子)


“开了7个任务,每个任务都分配3核心”这种做法纯属瞎折腾。建议最多也就同时开三个,否则会适得其反,资源竞争导致哪个都跑不顺畅。
对于你当前只有20核的情况,开两个每个给10核还算能接受。如果涉及到硬盘大量读写的任务,一次应当只开一个。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-4-25 11:56:39 | 只看该作者 Only view this author
songxiangan 发表于 2020-4-24 22:00
刚找到了这个,挺好!
http://sobereva.com/392

我的推荐做法是:
关闭超线程。
开着并不会显著提升性能, 关闭也不会显著降低性能。
如果开着,可能会带来不必要的麻烦,
比如,不停问,我这个CPU怎么利用率不高啊,
或者,上来一看, 哇40个CPU,然后就来个40个CPU的计算之类的。
所以,还是关闭最简单。

同时推荐,干活的机器就是干活的机器。
随便弄一个n手的Thinkpad,作为计算显示登陆的前端,是最好不过了。
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发表于 Post on 2020-4-26 15:08:11 | 只看该作者 Only view this author
原理我也不太懂,但是我的經驗是,cpu 佔用率似乎是考慮了超線程的情況下的佔用率。你把核心數設大一倍(因為線程數是實際核心數的2倍),cpu 佔用率就可以上去100%,但實際上計算速度不會更快(原理可以看sob 關於超線程的文章),所以不用執著100% 佔用率的問題。

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发表于 Post on 2020-5-18 09:40:48 | 只看该作者 Only view this author
用linux,win的高斯效率极低

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发表于 Post on 2020-5-18 16:07:20 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2020-5-18 09:40
用linux,win的高斯效率极低

请问g16A WIN版 和 g09D Linux版 进行同一opt-freq任务 有可比性性吗 还是说 还是g09D Linux版快一些?

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