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[GROMACS] gmx是从什么层面去描述原子间相互作用?

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卢老师,gmx 是基于经典力学定义的简单的势函数描述原子间相互作用,请问老师,用gmx 计算及描述和展示体系涉及到量子化学层面吗?

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发表于 Post on 2020-5-7 16:30:32 | 只看该作者 Only view this author
不直接涉及
但bond angle dihedral这些变量就是根据量化来拟合的

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发表于 Post on 2020-5-7 21:09:56 | 只看该作者 Only view this author
“量子化学的角度进行分析”语义不明。这和gmx计算没有直接关系

gmx定义成键项本身也并不牵扯任何量子化学理论,只能说某个力场在搞成键项参数的时候是怎么搞的。有很多力场是基于实验数据弄的成键项参数,此时和量子化学计算也没任何直接关系。
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发表于 Post on 2020-5-8 08:51:56 | 只看该作者 Only view this author
明园 发表于 2020-5-7 22:11
好的谢谢卢老师,还想问一下卢老师如果在GAFF力场下计算出来的体系,能从量化的层面去解释体系展现出来的 ...

看不懂你的这种问法

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