请求推荐模拟DNA互补配对后结构的软件

情随风去 · 发表于 Post on 2020-5-24 10:21:24

老师们好，我使用社长推荐的avogadro创建了一些单链DNA分子，现在想预测并测量它们碱基互补配对的高级结构，包括但不限于：
自身碱基互补配对形成茎环
彼此间碱基互补配对形成类似二维DNA origami的结构
请问有什么软件可以预测？谢谢！

youzy · 发表于 Post on 2024-1-30 18:02:54

您好！我和您的需求很相似，不知道是否找到解决方案？求指教。我需要的是具有hairpin结构的ssDNA的pdb文件

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[蛋白质建模] 请求推荐模拟DNA互补配对后结构的软件