MS搜索过渡态自动配对出问题

卡开发发

ysmmsy8 发表于 2021-9-8 19:46
产生的过渡态的频率计算有两个虚频，一个频率是-140，对应的强度为186.57 km/mol；一个频率是-10.6，对应 ...

可以，具体看看图和详细信息吧，比如振动模式等。

ysmmsy8

卡开发发 发表于 2021-9-9 00:07
可以，具体看看图和详细信息吧，比如振动模式等。

下图1是震动频率和强度

下图2是-10.6的频率对应的模型，与产物结构类似，只是结构角度的微调
下图3从左往右分别是反应物、过渡态、产物

下图4是过渡态搜索得到的能量

ysmmsy8

wzkchem5 发表于 2021-9-8 21:48
建议从这个过渡态往产物的反方向优化，尝试找到中间体，再用TS search找这个中间体和反应物之间的过渡态

我根据这个过渡态搜索得到的轨迹图做了好几个中间体的初猜模型，结构优化后，不是反应物的结构，就是产物的结构。。。。。。

wzkchem5

ysmmsy8 发表于 2021-9-9 02:36
我根据这个过渡态搜索得到的轨迹图做了好几个中间体的初猜模型，结构优化后，不是反应物的结构，就是产物 ...

第一确保初猜结构和过渡态足够近，第二把优化步长调得比平时小，再试

ysmmsy8

wzkchem5 发表于 2021-9-9 15:32
第一确保初猜结构和过渡态足够近，第二把优化步长调得比平时小，再试

好滴，谢谢老师的解答~

卡开发发

ysmmsy8 发表于 2021-9-9 09:34
下图1是震动频率和强度

下图2是-10.6的频率对应的模型，与产物结构类似，只是结构角度的微调

有个原因，可能是晶面太小。