lammps模拟NVT系综下辛烷在二氧化硅表面的吸附求助

Lacrimosa · 发表于 Post on 2022-1-13 21:24:27

WB1040720479 发表于 2022-1-12 16:14
就是在MS的sorption中是否将基底完全固定对结果没有什么影响，不知道在lammps是否一样；然后如果一般表面 ...

表面层原子的化学环境和体相本身就不同，结构不一样很正常。很多力场开发者已经考虑到了这个问题，所以由力场参数去决定表面结构更合理。在水-黏土的界面研究中就出现过类似的问题，旧力场参数未考虑到表面羟基的柔性，导致水在表面的分布不合理，文章标题我记不清了，应该是Cygan.R.T的某篇文章里提到的。至于是否会减小吸附量没法直接判断。

WB1040720479 · 发表于 Post on 2022-1-20 21:47:06

Lacrimosa 发表于 2022-1-13 21:24
表面层原子的化学环境和体相本身就不同，结构不一样很正常。很多力场开发者已经考虑到了这个问题，所以由 ...

我目前是切平面后构建layer直接sorption的。如果需要通过力场来决定表面结构，只需要几何优化嘛还是需要NVT跑MD？

moluren · 发表于 Post on 2022-5-1 21:21:31

请教楼主我也在练习气体吸附在硅基质中，但是设置参数时，有写参数不知改如何设置，能否请楼主分享一下自己的in文件，学习一下呢，在此谢过了

Decay · 发表于 Post on 2022-7-4 22:52:31

求个in文件万分感谢

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