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楼主 Author: 978142355
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[Gaussian/gview] Gaussian计算非人为使其计算停止了,能否接着其继续向下算。

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发表于 Post on 2015-9-29 23:24:48 | 只看该作者 Only view this author
对于几何优化,restart其实没什么意义,直接用最后的结构,照常写个优化任务重新算就行了。
restart只不过是能读取之前近似更新出来的Hessian矩阵,但这无所谓。

如果就是想用restart方式续算,把临时文件备份一下然后试就行了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-29 23:32:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-29 23:24
对于几何优化,restart其实没什么意义,直接用最后的结构,照常写个优化任务重新算就行了。
restart只不过 ...

soga,就是把中途poweroff留下的out转成gjf,重新算对吧?对于其它的非优化的,比如:ts,语句我看到了:# Opt=(QST2,Restart) ...
感觉opt的restart没算成功,其它的就更没有底了。我看其它某个论坛里写的天花乱坠的,结果还是不好使,故而疑惑了。。。。。。还望sob不要见笑。
淡泊以明志,宁静以致远。

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发表于 Post on 2015-9-29 23:57:48 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2015-9-29 23:32
soga,就是把中途poweroff留下的out转成gjf,重新算对吧?对于其它的非优化的,比如:ts,语句我看到了: ...

对,gview打开,保存个新的gjf
TS本质上也是优化,只不过优化的目标不是极小点而是一阶鞍点。无论是opt=ts还是QST2,都拿最后结构保存成新的gjf,然后opt(TS,calcfc,noeigen)当新任务接着算就完了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-30 16:43:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-29 23:57
对,gview打开,保存个新的gjf
TS本质上也是优化,只不过优化的目标不是极小点而是一阶鞍点。无论是opt= ...

谢sob老师详细的解答。
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发表于 Post on 2020-6-2 09:32:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-29 02:47
怎么续算这里有全面的总结
http://www.gaussian.com/g_blog/faq2.htm

多谢大神指点orz

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发表于 Post on 2020-11-27 09:05:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-29 23:57
对,gview打开,保存个新的gjf
TS本质上也是优化,只不过优化的目标不是极小点而是一阶鞍点。无论是opt= ...

sob老师,借此机会问你一下,# opt=restart,freq 这种写法,用GV打开文件时会提示incomplete strutures were deleted. May be a restarted or incomplete job. 打开后不能看振动,用文本文件查看,是输出了热力学量的应该是已经做过频率分析了。请问这个问题改怎么解决?
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发表于 Post on 2020-11-27 10:57:38 | 只看该作者 Only view this author
kevin 发表于 2020-11-27 09:05
sob老师,借此机会问你一下,# opt=restart,freq 这种写法,用GV打开文件时会提示incomplete strutures  ...

自行对输出文件想办法移花接木,或者用VMD看
在VMD中绘制Gaussian计算的分子振动矢量的方法
http://sobereva.com/567http://bbs.keinsci.com/thread-19287-1-1.html
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发表于 Post on 2020-11-28 23:08:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-27 10:57
自行对输出文件想办法移花接木,或者用VMD看
在VMD中绘制Gaussian计算的分子振动矢量的方法
http://sob ...

谢谢sob老师,我学习一下
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发表于 Post on 2021-3-1 11:16:57 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,请问单点能的计算该怎样续算呀?我的高斯作业重原子超过了7个,使用的方法是CCSD (T)/cc-pVQZ ,现在由于在超算中心的计算超过了7天,系统自动停止了计算,不想之前七天的时间白费了,想请教一下有没有挽救的方法,非常感谢!

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发表于 Post on 2021-3-2 01:58:48 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-3-1 11:16
各位老师,请问单点能的计算该怎样续算呀?我的高斯作业重原子超过了7个,使用的方法是CCSD (T)/cc-pVQZ , ...



7天还算不完的情况明显应当改用DLPNO-CCSD(T),或者用CCSD(T)/cc-pVDZ-F12代替
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发表于 Post on 2021-3-2 09:35:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-2 01:58
7天还算不完的情况明显应当改用DLPNO-CCSD(T),或者用CCSD(T)/cc-pVDZ-F12代替

sob老师,续算的问题按照您发的PPT上的命令语句已经解决了,最开始问题出在调用临时文件夹里的 .rwf文件上,选择重新调用就能成功。CCSD(T)/cc-pVQZ方法在高斯上计算确实非常的慢,我还想问一下,您提到的 改用DLPNO-CCSD(T),或者用CCSD(T)/cc-pVDZ-F12代替 请问这两种替代方式也可以在高斯上实现吗?

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发表于 Post on 2021-3-2 09:46:26 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-3-2 09:35
sob老师,续算的问题按照您发的PPT上的命令语句已经解决了,最开始问题出在调用临时文件夹里的 .rwf文件 ...

都不能。都可以在ORCA软件做。
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发表于 Post on 2021-3-2 11:15:50 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-3-2 09:46
都不能。都可以在ORCA软件做。

嗯嗯,明白了,谢谢老师您的回复!

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发表于 Post on 2021-3-3 01:32:32 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-3-2 09:35
sob老师,续算的问题按照您发的PPT上的命令语句已经解决了,最开始问题出在调用临时文件夹里的 .rwf文件 ...

这俩方法此文都提了
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html
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发表于 Post on 2021-3-5 10:56:39 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢sob老师您的回复,我刚按照您的博文在超算账号上安装好了Orca软件,也读了您的帖子,我看到Multiwfn产生ORCA输入文件中的方法12,  12 Approximated CCSD(T)/CBS with help of MP2 (cc-pVTZ->QZ extrapolation)  我当前的单点能计算是用G16结合您的小程序 enecalc 中的CBS外推方法,我可以认为12的方法和enecalc中CBS外推方法是一样的吗?如果改用Orca计算单点能,它和高斯同样的方法得到的结果是一样的吗?会不会需要校正?

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