求助均方位移脚本编写中的理解

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2020-7-12 16:17:37

请教各位老师，我在编写求msd脚本的时候，理解公式，粒子位移量的平方随时间的变化。其中位移量平方是否可以直接理解为 r(t) - r(0) :
(x1-x2)**2 + (y1-y2)**2 + (z1 - z2)**2 呢？就不开根号了

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-13 09:17:13

r(t) - r(0)和(x1-x2)**2 + (y1-y2)**2 + (z1 - z2)**2 明显不对应，前者是位移矢量，后者是位移幅度的平方

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2020-7-13 09:48:06

sobereva 发表于 2020-7-13 09:17
r(t) - r(0)和(x1-x2)**2 + (y1-y2)**2 + (z1 - z2)**2 明显不对应，前者是位移矢量，后者是位移幅度的平 ...

尊敬的sob老师，我已经明白您的意思了，我还有一个问题，假如我们求一个粒子在经历一帧后的msd，单个粒子的初始位置为（x1,y1,z1）,结束位置为（x2,y2,z2）。我们求它位移量的平方根据三维坐标求两点的距离公式：距离 d=√[(x1-x2)^2+(y1-y2)^2+(z1-z2)^2 ]。那它的位移量的平方不就是根号内部的加和么？

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-13 11:03:07

少年爱吃地三鲜发表于 2020-7-13 09:48
尊敬的sob老师，我已经明白您的意思了，我还有一个问题，假如我们求一个粒子在经历一帧后的msd，单个粒子 ...

是的。所以你没必要开根号再求平方

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2020-7-13 14:22:53

sobereva 发表于 2020-7-13 11:03
是的。所以你没必要开根号再求平方

感谢您的回复！~~

602015617 · 发表于 Post on 2021-7-13 19:10:14

您好，请问您是在VMD里编写求MSD的脚本吗？

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