计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7107|回复 Reply: 12
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 求助AV1245指数的正负值比较大小

[复制链接 Copy URL]

167

帖子

0

威望

1039

eV
积分
1206

Level 4 (黑子)

http://bbs.keinsci.com/thread-15137-1-1.html使用Multiwfn计算AV1245指数研究大环的芳香性
老师好,我在学习上面帖子 计算AV1245指数时,计算得到了负值,帖子中提到“
数值越大说明共振效应越强,也因此暗示这些原子所在的环的相应区域的共轭效应比较强
请问老师,负值算不算错误呢?负值和正值的比较是否要看负号(负数<正数)还是看绝对值的大小呢?

谢谢老师

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-7-19 21:37:36 | 只看该作者 Only view this author
带符号对比
先确保没用弥散函数(除非你用基于NAO形式算AV1245)
轻微的负值直接当成0
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

167

帖子

0

威望

1039

eV
积分
1206

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-20 09:52:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-19 21:37
带符号对比
先确保没用弥散函数(除非你用基于NAO形式算AV1245)
轻微的负值直接当成0

谢谢老师
我用的简单的6-31G(d)基组

167

帖子

0

威望

1039

eV
积分
1206

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-26 12:21:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-19 21:37
带符号对比
先确保没用弥散函数(除非你用基于NAO形式算AV1245)
轻微的负值直接当成0

还想继续请教老师,AV1245是否可以计算整个分子的共轭度呢,比如C60这样的一个球体,
我尝试将C60分子 输入1-60 得到了具体数值:0.18713266
是否可以说C60分子的共轭为0.18713266呢?

11 AV1245 index (approximate multicenter bond order for large rings) and AVmin
11

                         ------- AV1245 and AVmin -------
Input index of the atoms in the order of connectivity, e.g. 2,3,7,18,19,20
To exit, input "q"
Hint: If input "d" and press ENTER button, then you can input the indices in ar
bitrary order because the actual order will be automatically guessed, however in
this case any atom should not connect to more than two atoms in the ring
d
Generating bonding relationship...
Note: If distance between two atoms is smaller than sum of their covalent radii
multiplied by  1.150, then they are regarded as bonded

Input index of the atoms, the order is arbitrary
For example: 1,3-4,6-8,10-14
1-60
The order of the atoms in the ring has been successfully identified

Number of selected atoms:    60
Atomic sequence:
     1     2     5    11     7     3     8    15    14    23    29    19
    20    12    21    13     6     9     4    10    16    25    28    18
    26    17    27    22    32    31    41    30    40    39    43    33
    35    24    34    44    45    53    52    57    49    50    51    42
    47    37    36    46    38    48    56    54    55    58    60    59

4-center electron sharing index of     1     2    11     7:    0.00361575
4-center electron sharing index of     2     5     7     3:    0.00362024
4-center electron sharing index of     5    11     3     8:    0.00105940
4-center electron sharing index of    11     7     8    15:    0.00027574
4-center electron sharing index of     7     3    15    14:   -0.00176890
4-center electron sharing index of     3     8    14    23:    0.00027277
4-center electron sharing index of     8    15    23    29:   -0.00031044
4-center electron sharing index of    15    14    29    19:   -0.00004441
4-center electron sharing index of    14    23    19    20:   -0.00004389
4-center electron sharing index of    23    29    20    12:   -0.00031124
4-center electron sharing index of    29    19    12    21:    0.00084605
4-center electron sharing index of    19    20    21    13:   -0.00031035
4-center electron sharing index of    20    12    13     6:   -0.00004410
4-center electron sharing index of    12    21     6     9:   -0.00004368
4-center electron sharing index of    21    13     9     4:   -0.00031074
4-center electron sharing index of    13     6     4    10:    0.00084606
4-center electron sharing index of     6     9    10    16:   -0.00031066
4-center electron sharing index of     9     4    16    25:   -0.00030995
4-center electron sharing index of     4    10    25    28:    0.00027433
4-center electron sharing index of    10    16    28    18:   -0.00176526
4-center electron sharing index of    16    25    18    26:    0.00027733
4-center electron sharing index of    25    28    26    17:   -0.00030997
4-center electron sharing index of    28    18    17    27:   -0.00031009
4-center electron sharing index of    18    26    27    22:    0.00084475
4-center electron sharing index of    26    17    22    32:   -0.00031005
4-center electron sharing index of    17    27    32    31:   -0.00031014
4-center electron sharing index of    27    22    31    41:    0.00084460
4-center electron sharing index of    22    32    41    30:   -0.00031012
4-center electron sharing index of    32    31    30    40:   -0.00031028
4-center electron sharing index of    31    41    40    39:    0.00084487
4-center electron sharing index of    41    30    39    43:   -0.00030996
4-center electron sharing index of    30    40    43    33:   -0.00031009
4-center electron sharing index of    40    39    33    35:    0.00084455
4-center electron sharing index of    39    43    35    24:   -0.00031006
4-center electron sharing index of    43    33    24    34:   -0.00031013
4-center electron sharing index of    33    35    34    44:    0.00027686
4-center electron sharing index of    35    24    44    45:   -0.00176906
4-center electron sharing index of    24    34    45    53:    0.00027381
4-center electron sharing index of    34    44    53    52:   -0.00030978
4-center electron sharing index of    44    45    52    57:   -0.00031072
4-center electron sharing index of    45    53    57    49:    0.00084588
4-center electron sharing index of    53    52    49    50:   -0.00031072
4-center electron sharing index of    52    57    50    51:   -0.00004455
4-center electron sharing index of    57    49    51    42:   -0.00004463
4-center electron sharing index of    49    50    42    47:   -0.00031058
4-center electron sharing index of    50    51    47    37:    0.00084600
4-center electron sharing index of    51    42    37    36:   -0.00031042
4-center electron sharing index of    42    47    36    46:   -0.00004437
4-center electron sharing index of    47    37    46    38:   -0.00004392
4-center electron sharing index of    37    36    38    48:   -0.00031124
4-center electron sharing index of    36    46    48    56:    0.00027371
4-center electron sharing index of    46    38    56    54:   -0.00177605
4-center electron sharing index of    38    48    54    55:    0.00027353
4-center electron sharing index of    48    56    55    58:    0.00106050
4-center electron sharing index of    56    54    58    60:    0.00361770
4-center electron sharing index of    54    55    60    59:    0.00361581
4-center electron sharing index of    55    58    59     1:    0.00000972
4-center electron sharing index of    58    60     1     2:   -0.00004059
4-center electron sharing index of    60    59     2     5:   -0.00004058
4-center electron sharing index of    59     1     5    11:    0.00000971

AV1245 times 1000 for the selected atoms is    0.18713266
AVmin times 1000 for the selected atoms is     0.009712 (   59    1    5   11)

                         ------- AV1245 and AVmin -------
Input index of the atoms in the order of connectivity, e.g. 2,3,7,18,19,20
To exit, input "q"
Hint: If input "d" and press ENTER button, then you can input the indices in ar
bitrary order because the actual order will be automatically guessed, however in
this case any atom should not connect to more than two atoms in the ring

























6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2020-7-26 21:01:56 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2020-7-26 12:21
还想继续请教老师,AV1245是否可以计算整个分子的共轭度呢,比如C60这样的一个球体,
我尝试将C60分子  ...

这么算没有意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

167

帖子

0

威望

1039

eV
积分
1206

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-27 10:01:13 | 只看该作者 Only view this author

1、请问老师是指算整个分子的共轭没有意义还是我上述的计算做法没有意义呢?
2、如果是我不能用AV1245计算,那么是否有其他方法呢?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2020-7-28 05:43:33 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2020-7-27 10:01
1、请问老师是指算整个分子的共轭没有意义还是我上述的计算做法没有意义呢?
2、如果是我不能用AV1245计 ...

不适合用于球形体系,而只能用于环
球形芳香性专门有别的方法讨论,google一搜一堆
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

53

eV
积分
60

Level 2 能力者

8#
发表于 Post on 2024-12-11 22:46:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-28 05:43
不适合用于球形体系,而只能用于环
球形芳香性专门有别的方法讨论,google一搜一堆

您好,我请问一下如果我计算一个苯并咔唑的AV1245常数,我可以进行一个整体计算嘛?还是去找适当的共轭途径,这两种哪种更贴切实际。还有就是我是拿优化好的基态就可以计算了,还是拿其他的激发态比如单线态激发态或者三线态的激发态。可能问的有点蠢,您别介意

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2024-12-11 23:41:10 | 只看该作者 Only view this author
杜纪宽 发表于 2024-12-11 22:46
您好,我请问一下如果我计算一个苯并咔唑的AV1245常数,我可以进行一个整体计算嘛?还是去找适当的共轭途 ...

没有“常数”这种称呼

“整体计算”语义不明。直接算多中心键级就完了,对你感兴趣的共轭路径计算

若无特殊情况当然用基态极小点的基态波函数做计算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

53

eV
积分
60

Level 2 能力者

10#
发表于 Post on 2024-12-12 09:16:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-11 23:41
没有“常数”这种称呼

“整体计算”语义不明。直接算多中心键级就完了,对你感兴趣的共轭路径计算

比如苯并咔唑这种材料,我能不能全选C与N原子计算AV1245指数,然后以此来衡量它的共轭程度

202412120914159280..png (30.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

202412120914159280..png

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2024-12-12 09:20:06 | 只看该作者 Only view this author
杜纪宽 发表于 2024-12-12 09:16
比如苯并咔唑这种材料,我能不能全选C与N原子计算AV1245指数,然后以此来衡量它的共轭程度

不能
对这种情况本来就没法确切定义共轭程度。用LOL-pi分析,根据最小的二分点数值讨论倒是一定程度上可以
在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征
http://sobereva.com/432http://bbs.keinsci.com/thread-10610-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

53

eV
积分
60

Level 2 能力者

12#
发表于 Post on 2024-12-12 09:21:51 | 只看该作者 Only view this author

能请教一下如何去衡量嘛

7

帖子

0

威望

53

eV
积分
60

Level 2 能力者

13#
发表于 Post on 2024-12-12 09:34:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-12 09:20
不能
对这种情况本来就没法确切定义共轭程度。用LOL-pi分析,根据最小的二分点数值讨论倒是一定程度上可 ...

谢谢您

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 18:57 , Processed in 0.351532 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list