计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7769|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它量化程序] 请教Dmol3处理N掺杂碳团簇与Pt4复合体系结构优化时报错、重启问题。

[复制链接 Copy URL]

161

帖子

0

威望

1210

eV
积分
1371

Level 4 (黑子)

本帖最后由 monoyu 于 2020-7-25 16:42 编辑

本人在用Dmol3处理N掺杂碳团簇与Pt4复合体系结构优化时,会时常遇到程序突然报错、机器重启的情况。想请教一下各位老师一般是什么问题。机器:3950X+64GB内存     MS2018     WIN10 PRO 1903
PS:
# Task parameters                                                                                                                  
Calculate                     optimize                                                                                             
Opt_energy_convergence        1.0000e-005                                                                                          
Opt_gradient_convergence      2.0000e-003 A                                                                                         
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A                                                                                         
Opt_iterations                400                                                                                                   
Opt_max_displacement          0.3000 A                                                                                         
Initial_hessian               improved                                                                                          
Symmetry                      off                                                                                          
Max_memory                    2000                                                                                                
File_usage                    smart                                                                                                
Scf_density_convergence       1.000000e-006                                                                                       
Scf_charge_mixing             2.000000e-001                                                                                    
Scf_spin_mixing               5.000000e-001                                                                                      
Scf_diis                      6 pulay                                                                                             
Scf_iterations                400                                                                                               

# Electronic parameters                                                                                                            
Spin_polarization             unrestricted                                                                                         
Charge                        0                                                                                                     
Basis                         dnp                                                                                               
basis_version                 basfile_v4.4                                                                                       
Pseudopotential               dspp                                                                                                
Functional                    pbe                                                                                                   
Aux_density                   hexadecapole                                                                                       
Dftd                          TS                                                                                                
Integration_grid              fine                                                                                                
Occupation                    thermal 0.0050                                                                                       
Cutoff_Global                 5.0000 angstrom






Pt4-NPC1.jpg (200.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

Pt4-NPC1.jpg

Pt4-NPC2.jpg (51.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

Pt4-NPC2.jpg

Pt4-NPC.outmol

646.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125140

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-7-26 01:22:34 | 只看该作者 Only view this author
怀疑机子有硬件层面的问题
建议跑跑其它高负载程序看看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

611

帖子

2

威望

4455

eV
积分
5106

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2020-7-26 09:03:45 | 只看该作者 Only view this author
Scf_diis                      6 pulay   
这一行改成
Scf_diis                      9 kresse
试试,然后用files->run files来跑看看?  

161

帖子

0

威望

1210

eV
积分
1371

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-26 11:36:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 monoyu 于 2020-7-26 11:39 编辑
sobereva 发表于 2020-7-26 01:22
怀疑机子有硬件层面的问题
建议跑跑其它高负载程序看看

谢谢社长。我也考虑过硬件层面的问题,主要是内存。这套平台一开始配了两条镁光DDR4 3200AA 32GB的条子,插主板2、4槽组双通道,跑上述优化任务时出现了报错,而且有时任务开始运行没多久就出问题重启,有时运行长时间后报错重启。但当时没怀疑内存问题,因为FPU烤机和内存烤机都没出什么问题。后来重装系统、重装软件没改善后,换了两条海盗船 DDR4 2666 16GB的条子试了下,不过只跑了1次任务,没有报错地结束了。随后退了镁光DDR4 3200AA 32GB的条子,换了您帖子中的海盗船DDR4 3200 32GB的,运行任务结果又出问题了。每换一次内存后都跑过FPU烤机和内存烤机,也都没出什么问题。所以现在有点懵。另外,上述品牌和规格的内存,也都用ORCA跑过一个结构优化的小任务,不过任务较小,用时只有20分钟左右,期间还测试了阿斯加特的DDR4 3000 16GB×2,都没出问题的成功跑完了。

161

帖子

0

威望

1210

eV
积分
1371

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-27 11:18:53 | 只看该作者 Only view this author
zyj19831206 发表于 2020-7-26 09:03
Scf_diis                      6 pulay   
这一行改成
Scf_diis                      9 kresse

谢谢。我试一下。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 20:47 , Processed in 0.188831 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list