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[Material Studio] 使用Dmol3计算ORR电催化反应自由能变时出现负值如何操作

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发表于 Post on 2020-8-5 22:39:39 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
电催化剂模型是氮掺杂石墨烯为基底的Fe@Co3O4,因为本身时间很紧所以选择了Dmol3
以下我的是操作步骤,希望大神帮忙指正:
1.使用Dmol3对初始进行几何优化并计算分子能量
2.在优化好的模型上选择位点,依次连接OOH,O,OH,O2(均为在前一步反应优化完成后对模型进行修改,再进行下一步优化)
3.找到outmol文件中最后的total energy,作为分子能量
4.建模H2,H2O(放入盒子里),使用dmol3进行能量计算
5.按照方程式计算每步反应的能量变化

算出来的结果中第一步算出来的能量变化总是负值,和标准值差的也有点大,不知道问题出在哪里。
以下是几何优化过程的一些数据和计算结果,求大神帮忙指点一下
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@卡开发发 请大神帮忙看看

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发表于 Post on 2020-8-6 06:18:42 | 显示全部楼层 Show all
1、一般还是建议开放自旋多重度(auto),然后use formal spin,初猜自旋在modify-electronic configuration设置。
2、preconditioner我测试下来效果不是很好,建议先别用,smearing也过大了,可能算不到可靠的结果。
3、分子没必要放到盒子去算。
4、文献结果我不确定是用的自由能还是能量。

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人在魔都,处理小区事项,近期不在。

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发表于 Post on 2022-1-15 21:32:20 | 显示全部楼层 Show all
本帖最后由 huangbing- 于 2022-1-15 21:45 编辑

想请问一下您后面发现是什么问题了吗?

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