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[VASP] 使用vaspkit的105功能转换cif文件时部分元素未识别

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本帖最后由 centos 于 2020-8-31 18:06 编辑

在使用m建模s导出cif文件后,运行vaspkit105的功能生成POSCAR,掺杂的元素没有被识别,在POSCAR写的还是替代之前的元素,修改了一下后可以识别掺杂的元素。使用的vaspkit版本是1.2。
方法是下载下来的文件复制的vaspkit的安装目录的utilities里,记得复制之前先把原来的cif2pos.py备份一下,mv cif2pos.py cif2pos.py.bak
第二次修改,重新修改了第一次发的文件

cif2pos - 副本.py

380.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 52

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发表于 Post on 2020-8-21 10:15:28 | 只看该作者 Only view this author
谢谢改进,该版本将会包含到vaspkit新版本中。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-31 18:04:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 centos 于 2020-8-31 18:11 编辑
wangvei 发表于 2020-8-21 10:15
谢谢改进,该版本将会包含到vaspkit新版本中。

老师,经过我几天的使用,发现之前的修改的在遇到vaspkit的4063功能生成的cif文件和vesta生成的cif文件时会出现元素未识别,我又重新修改了一下,解决了这个问题以及最开始提到的问题,希望老师能重新下载一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-31 18:28:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 centos 于 2020-8-31 23:26 编辑

重新编辑修改了第一次发的,在这里补充一下。这个问题偶然出现的,测试了几个替换元素模型没有出现这个问题。每次提交任务前检查一下输入文件。

cif文件.png (10.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

m(模型)s导出的cif文件

m(模型)s导出的cif文件

原来.png (6.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

使用vaspkit

使用vaspkit

修改.png (1.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

使用修改之后的

使用修改之后的

修改POSCAR.png (11.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

使用修改以后生成POSCAR

使用修改以后生成POSCAR

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