过渡态只有一个虚频，还需要优化吗？

wuyulele · 发表于 Post on 2020-12-31 00:12:46

多次拒绝斯佳丽发表于 2020-12-30 20:37
请问您解决了吗？需不需要把所谓过渡态结构拿出来优化后再进行虚频计算呀？谢谢

我也没有解决呢。。

多次拒绝斯佳丽 · 发表于 Post on 2020-12-31 09:07:09

wuyulele 发表于 2020-12-31 00:12
我也没有解决呢。。

好难啊难受

qwe1832518773 · 发表于 Post on 2021-1-11 13:22:25

我是大帅逼发表于 2020-9-15 10:56
嗯嗯，我试试
请问你有没有遇到过NEB算完，结构挺像过渡态的，但一优化结构就变得一点都不像过渡态，
...

过渡态任务（NEB或dimer）和结构优化任务是不一样的，NEB（或dimer）收敛的结果才可能是过渡态，不能中途去加个结构优化

朱陈 · 发表于 Post on 2021-1-19 19:13:59

你做了freq分析之后，把这个结构拿出来，继续用dimer方法找过渡态。

我是大帅逼 · 发表于 Post on 2021-3-6 16:53:55

多次拒绝斯佳丽发表于 2020-12-30 20:37
请问您解决了吗？需不需要把所谓过渡态结构拿出来优化后再进行虚频计算呀？谢谢

我是都优化了的

我是大帅逼 · 发表于 Post on 2021-3-6 16:54:47

wuyulele 发表于 2020-12-28 17:21
是的，我也碰到这种情况了，请问你后来如何解决的呢？

我是先优化，不行的话就用dimer

wuyulele · 发表于 Post on 2021-3-9 10:14:07

我是大帅逼发表于 2021-3-6 16:54
我是先优化，不行的话就用dimer

好的谢谢~

yss · 发表于 Post on 2023-1-9 18:35:54

多次拒绝斯佳丽发表于 2020-12-30 20:37
请问您解决了吗？需不需要把所谓过渡态结构拿出来优化后再进行虚频计算呀？谢谢

问一下不优化找到一个虚频还要优化吗？请问您当时怎么解决的呢？

yss · 发表于 Post on 2023-1-9 18:47:59

wuyulele 发表于 2020-12-28 17:21
是的，我也碰到这种情况了，请问你后来如何解决的呢？

问一下不优化找到一个虚频还要优化吗？请问您当时怎么解决的呢？

yss · 发表于 Post on 2023-1-9 18:49:53

我想问一下过渡态需要优化在算频率吗请问您当时怎么解决的

yss · 发表于 Post on 2023-1-9 20:37:29

zjxitcc 发表于 2020-9-12 15:03
这只能作为参考看看而已，不能作为最终结果。必须要经过过渡态结构优化这一过程，因为正常收敛后力才是 ...

这样要不要把过渡态单拎出来做构型优化了还是直接做频率计算？

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-1-9 21:12:13

本帖最后由 zjxitcc 于 2023-1-9 21:13 编辑

yss 发表于 2023-1-9 20:37
这样要不要把过渡态单拎出来做构型优化了还是直接做频率计算？

没必要在一个帖子里重复4次问几乎一样的问题。

这里面存在着一些容易混淆的地方，需要先说清一下，以Gaussian程序为例，一般说“优化”指的是优化得到极小点几何结构，关键词最少要包含opt；一般说“优化过渡态”指的是优化得到一阶鞍点几何结构，关键词最少要包含opt=ts。

所以我不知道你说的“构型优化”究竟是什么意思，“单拎出来”也令人费解。我只能用标准回答：要先优化过渡态（即寻找过渡态结构），保证过渡态结构的力为零，然后做频率分析，看是否有且仅有一个虚频。如果力不为零就直接去做频率计算，即使有且仅有一个虚频，也不能说是过渡态。

JCenter · 发表于 Post on 2023-4-15 00:09:45

sobereva 发表于 2020-9-13 04:04
过渡态附近的二次区域内的所有结构都像TS一样有且只有一个虚频。必须受力也很小，才能作为TS

老师，想请教您一个问题：过渡态的虚频值是固定不变的吗，还是说一个温度会对应一个虚频值，普通的freq任务应该是默认298.15k下进行振动分析的。如果虚频值是与温度一一对应的，那用于计算反应速率常数k的excel中透射系数计算所需要的虚频值是要在自己的体系温度下进行振动分析任务，才能得到相应的虚频值吗

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-15 00:38:20

JCenter 发表于 2023-4-15 00:09
老师，想请教您一个问题：过渡态的虚频值是固定不变的吗，还是说一个温度会对应一个虚频值，普通的freq任 ...

频率与温度无关
温度只影响不同振动态的分布比例（Boltzmann分布关系）

JCenter · 发表于 Post on 2023-4-15 09:48:41

sobereva 发表于 2023-4-15 00:38
频率与温度无关
温度只影响不同振动态的分布比例（Boltzmann分布关系）

好的，学生明白了，谢谢老师！

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[VASP] 过渡态只有一个虚频，还需要优化吗？