求助: 从COD晶体下载来的Fe3O4的晶体结构，为什么看原子性质的时候charge为0

ocbrother · 发表于 Post on 2020-9-23 14:32:51

从COD下载的Fe3O4的晶体结构，用MS打开后，点击每一个原子，在properties里面的charge显示都是0，照理说四氧化三铁不是应该含有三价铁、二价铁和氧离子吗？
求老师们指点迷津

naoki · 发表于 Post on 2020-9-23 14:52:12

这个晶体文件只包含了原子坐标和晶胞参数等信息吧，没有电荷信息

ocbrother · 发表于 Post on 2020-9-23 16:01:33

naoki 发表于 2020-9-23 14:52
这个晶体文件只包含了原子坐标和晶胞参数等信息吧，没有电荷信息

那我之后在进行分子动力学模拟的时候，要考虑晶体里面各个元素的电荷吗？
还是说我在选择力场的时候，比如compass力场，它会自动分配电荷吗？

naoki · 发表于 Post on 2020-9-23 16:09:56

ocbrother 发表于 2020-9-23 16:01
那我之后在进行分子动力学模拟的时候，要考虑晶体里面各个元素的电荷吗？
还是说我在选择力场的时候，比 ...

如果你打算用ms模拟的话，forcite模块里energy选项卡会让你选电荷的计算方法，可以选力场自动分配、使用当前电荷或者Qeq等算法。当然你也可以自己手动设定每个原子的电荷。

ocbrother · 发表于 Post on 2020-9-23 17:48:42

naoki 发表于 2020-9-23 16:09
如果你打算用ms模拟的话，forcite模块里energy选项卡会让你选电荷的计算方法，可以选力场自动分配、使用 ...

好的。谢谢你

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[综合交流] 求助: 从COD晶体下载来的Fe3O4的晶体结构，为什么看原子性质的时候charge为0