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[GAMESS-US] 双原子分子的势能面扫描(小白)

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$CONTRL RUNTYP=surface COORD=ZMT scftyp=rohf mult=2 $END
$SYSTEM TIMLIM=500 MEMORY=30000000 $END
$BASIS  GBASIS=sto ngauss=2 $END
$surf ndisp1=100 disp1=0.01 $end
$DATA
KHe ground state
Cnv 4

K
He 1 r

r=2.0
$END

运行后报错 NO ATOMS TO MOVE IN SURFACE MAPPING 请求大神解释!!
能详细介绍下ivec1和 orig1吗? 一直很费解不知道咋用。本人计算K原子和He原子的势能曲线  给位有好的方法建议吗?

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发表于 Post on 2015-10-26 00:43:31 | 只看该作者 Only view this author
这样写
$surf ivec1(1)=2,1 igrp1=1 orig1=0 ndisp1=100 disp1=0.01 $end

ivec1是包含两个元素的数组,定义对哪两个原子进行扫描。
orig1是被扫描变量的起始值,0代表用输入结构里的数值。
还得定义数组igrp1,必须包含ivec1里的第二个原子。这个数组里定义哪些原子作为刚性片段相对于第一个原子来移动。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-26 09:03:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-26 00:43
这样写
$surf ivec1(1)=2,1 igrp1=1 orig1=0 ndisp1=100 disp1=0.01 $end

太感谢了!!但是在输出文件里找不到像高斯那样 形成几列数值的summary  这要在哪里找呢?

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发表于 Post on 2015-10-26 10:59:24 | 只看该作者 Only view this author
sanjin 发表于 2015-10-26 09:03
太感谢了!!但是在输出文件里找不到像高斯那样 形成几列数值的summary  这要在哪里找呢?

自行用grep命令从输出文件中提取
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-26 11:02:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-26 10:59
自行用grep命令从输出文件中提取

我用的是windows版本的  也能用grep?

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发表于 Post on 2015-10-26 11:03:41 | 只看该作者 Only view this author
sanjin 发表于 2015-10-26 11:02
我用的是windows版本的  也能用grep?

不能。你可以拷到linux下面处理(可以装个虚拟机),或者用ultraedit,也可以批量找出来含有某一字符串的行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-26 15:18:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-26 11:03
不能。你可以拷到linux下面处理(可以装个虚拟机),或者用ultraedit,也可以批量找出来含有某一字符串的 ...

我用eom-CCSD算激发态势能曲线 如何指定其中的某一条呢?比如第一激发态或者第二激发态。

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发表于 Post on 2015-10-27 02:34:27 | 只看该作者 Only view this author
sanjin 发表于 2015-10-26 15:18
我用eom-CCSD算激发态势能曲线 如何指定其中的某一条呢?比如第一激发态或者第二激发态。


你做EOM-CCSD并且同时扫描变量,假设你设了算两个态,那么每个点也就会输出两个态的信息。要提取比如第二个态,就找输出文件中关键性的字符串,比如
THE TOTAL ENERGY OF ROOT   2 IS E(EOM-CCSD)
你用grep专门提取这行就行了。

如果是显示THE EOMCCSD ITERATIONS FOR ROOT NO.   2 HAVE CONVERGED,激发能在下面一行输出,你可以用
grep "THE EOMCCSD ITERATIONS FOR ROOT NO.   2 HAVE CONVERGED" scan.out -A1
把这一行连同下一行都提取出来。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-27 09:03:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-27 02:34
你做EOM-CCSD并且同时扫描变量,假设你设了算两个态,那么每个点也就会输出两个态的信息。要提取比如第 ...

我只找到了root No。1的能量。但怎么样才能得到更多的激发态呢。查了一下$EOMINP 其中有NSTATE IROOT关键字貌似可以指定激发态  但是他们的含义并不懂 求指导!

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sanjin 发表于 2015-10-27 09:03
我只找到了root No。1的能量。但怎么样才能得到更多的激发态呢。查了一下$EOMINP 其中有NSTATE IROOT关键 ...

写NSTATE(1)=2就能算两个了。
如果体系有对称性,需要写一个数组,指定每个不可约表示算几个态。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-27 10:52:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-27 09:29
写NSTATE(1)=2就能算两个了。
如果体系有对称性,需要写一个数组,指定每个不可约表示算几个态。

异核的二原子分子 应该是Cnv n为无穷 这该怎么表示?不可约表示与态有什么关系呢??

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发表于 Post on 2015-10-27 11:00:25 | 只看该作者 Only view this author
sanjin 发表于 2015-10-27 10:52
异核的二原子分子 应该是Cnv n为无穷 这该怎么表示?不可约表示与态有什么关系呢??

手册里有说明
For linear molecules, choose either Cnv or Dnh, and enter NAXIS as 4. Enter atoms as Dnh with NAXIS=2.

每个电子态都有的相应的不可约表示。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-27 15:57:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-27 11:00
手册里有说明
For linear molecules, choose either Cnv or Dnh, and enter NAXIS as 4. Enter atoms as ...

最后一个问题  请问Rb Cs这样的原子与He原子组合计算势能曲线 用什么基组比较好?

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发表于 Post on 2015-10-28 03:43:14 | 只看该作者 Only view this author
sanjin 发表于 2015-10-27 15:57
最后一个问题  请问Rb Cs这样的原子与He原子组合计算势能曲线 用什么基组比较好?

def2系列就挺好,比如def2-QZVP
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-28 09:34:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-28 03:43
def2系列就挺好,比如def2-QZVP

我在手册里没有找到这个基组 我是2013版的64位wingamess。

本版积分规则 Credits rule

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