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[新手求助] 两个结构类似的分子做柔性势能面扫描,结果差别很大,怎么回事?

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发表于 2020-10-30 10:58:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 sealanlan 于 2020-10-30 13:34 编辑

两个类似的分子,做开环反应的势能面扫描柔性opt过渡态优化,结果差别很大,怎么回事?第一个分子能够从闭合状态顺利地优化到开环状态,高斯view打开看中间文件过渡态一切正常




第二个分子从闭合态开始优化回不到开环状态,高斯view打开看从过渡态能量最高点开始,结构开始发生扭曲和变形,最终回不到开环状态


这是方法的问题,还是第二个分子结构不稳定导致的?

分子1-势能面扫描结果

分子1-势能面扫描结果

分子1-起始闭环结构

分子1-起始闭环结构

分子1-曲线最高点过渡态结构

分子1-曲线最高点过渡态结构

分子1-开环结构

分子1-开环结构

分子2-势能面扫描结果

分子2-势能面扫描结果

分子2-起始闭环结构

分子2-起始闭环结构

分子2-曲线最高点过渡态结构

分子2-曲线最高点过渡态结构

分子2-过渡态之后的扭曲变形结构

分子2-过渡态之后的扭曲变形结构
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