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[新手求助] 两个结构类似的分子做柔性势能面扫描，结果差别很大，怎么回事？

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sealanlan

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发表于 Post on 2020-10-30 10:58:47 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
本帖最后由 sealanlan 于 2020-10-30 13:34 编辑

两个类似的分子，做开环反应的势能面扫描柔性opt过渡态优化，结果差别很大，怎么回事？第一个分子能够从闭合状态顺利地优化到开环状态，高斯view打开看中间文件过渡态一切正常




第二个分子从闭合态开始优化回不到开环状态，高斯view打开看从过渡态能量最高点开始，结构开始发生扭曲和变形，最终回不到开环状态


这是方法的问题，还是第二个分子结构不稳定导致的？

QQ图片20201030104044.png (70.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

分子1-势能面扫描结果

分子1-势能面扫描结果

QQ图片20201030105123.png (71.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

分子1-起始闭环结构

分子1-起始闭环结构

QQ图片20201030104105.png (72.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

分子1-曲线最高点过渡态结构

分子1-曲线最高点过渡态结构

QQ图片20201030104156.png (74.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

分子1-开环结构

分子1-开环结构

QQ图片20201030105318.png (70.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)

分子2-势能面扫描结果

分子2-势能面扫描结果

QQ图片20201030105400.png (75.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

分子2-起始闭环结构

分子2-起始闭环结构

QQ图片20201030105608.png (76.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

分子2-曲线最高点过渡态结构

分子2-曲线最高点过渡态结构

QQ图片20201030105614.png (71.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

分子2-过渡态之后的扭曲变形结构

分子2-过渡态之后的扭曲变形结构
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