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[GROMACS] 求助使用CGenFF生成JZ4拓扑时出现报错

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发表于 2020-10-30 15:42:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
Traceback (most recent call last):
  File "cgenff_charmm2gmx.py", line 50, in <module>
    import numpy as np
ImportError: No module named numpy
networkx用的是1.1.1版本,Python是2.7.12  
处理好久了,不知道怎么解决

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Nerv

发表于 2020-10-30 15:44:36 | 显示全部楼层
对于CentOS 7.2,应运行yum install numpy和yum install python-networkx把这个脚本所需的包装上。
http://bbs.keinsci.com/thread-428-1-1.html
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 楼主| 发表于 2020-10-30 15:58:37 | 显示全部楼层
老师,我centos的版本是7.6

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Nerv

发表于 2020-10-30 16:00:02 | 显示全部楼层
逍彷 发表于 2020-10-30 15:58
老师,我centos的版本是7.6

报错中出现了ImportError: No module named numpy,看一下是否安装了numpy,我用的也是centos 7.6没有出现问题
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 楼主| 发表于 2020-10-30 16:03:42 | 显示全部楼层
Package 1:numpy-1.7.1-13.el7.x86_64 already installed and latest version
Nothing to do
安装了
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