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[综合交流] 求助,请问可以用什么样的一个参数能够表征多环芳烃吸附铵根离子的吸附作用强弱?

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发表于 2020-10-30 18:12:01 | 显示全部楼层 |阅读模式
问题1:如图,单体A是晕苯上的一个氢原子被羧基取代。单体B是铵根离子。然后用A来吸附B,他们之间的吸附是强相互作用还是弱相互作用呀?
问题2:如果是强相互作用的话,用什么参数可以表征出他们的吸附作用强弱呀?若是弱相互作用的话呢?
问题3:我在论坛上找到了一些比较零散的说法,有的说用结合能,有的说用吸附能,有的说用自由能,针对图上分子的吸附,请问该用以上哪个“能”来表示?具体的优化、算单点能用的方法、基组、输入文件的关键词怎么写呀?
问题4:想定性定量地表示这么个吸附作用的强弱,用Multiwfn可以分析吗?具体的分析步骤可以指导一下吗?

初识量化,基础知识薄弱,为此特意报名了下个月的Multiwfn班,但是害怕去了之后听不懂,想把这些疑问提前解决,这样的话到时候听课也会好上手一些,渴望得到sob老师和其他老师的指点,小弟在此不胜感激。

单体A(晕苯加羧基)

单体A(晕苯加羧基)

单体B(铵根离子)

单体B(铵根离子)

复合物AB

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发表于 2020-10-30 19:07:00 | 显示全部楼层
你首先把结构优化出来再说,怎么分析是之后的事

结合能是肯定得算的,通过结合能和结合后的结构就直接可以大致判断作用特征,之后再用Multiwfn从各个角度进行表征。衡量强度用的结合能就用E(AB)-E(A)-E(B)算,E就用电子能量就可以接受。这种体系,用M06-2X/6-311G*优化,再用M06-2X/6-311+G(2d,p)算单点就可以。

分析手段太多了,看
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252
培训班里我会详细讲,不用担心听不懂,所有幻灯片在发的讲义上都有,没搞明白的在培训群里问,我都会详细回答。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高水准的各种量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训,是提升计算化学研究水平的最佳选择。欢迎加入“北京科音”公众号获取培训最新消息和计算化学资讯!培训相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》(http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html)。
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 楼主| 发表于 2020-10-30 21:35:02 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2020-10-30 19:07
你首先把结构优化出来再说,怎么分析是之后的事

结合能是肯定得算的,通过结合能和结合后的结构就直接可 ...

问题1.单体A 单体B 复合物AB,这三部分优化和算单点能都用同样的方法和基组吗?
问题2.刚才对单体A的gif文件作优化写关键词时,编辑关键词M06-2X/6-311g*,gaussian计算显示出错。然后改成了M062X/6-311g*,也就是把M06和2X中间的“-”去掉了,gaussian正在计算中,目前没有显示出错,我这样做对吗,第一次gaussian显示出错原因是出自于这吗?

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发表于 2020-10-30 22:34:44 | 显示全部楼层
yang2020 发表于 2020-10-30 21:35
问题1.单体A 单体B 复合物AB,这三部分优化和算单点能都用同样的方法和基组吗?
问题2.刚才对单体A的gif ...

1、对,相同计算水平下得到的能量才能互相比较;
2、对,Gaussian里使用M06-2X泛函就是要写"M062X",可以不区分字母大小写。

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 楼主| 发表于 2020-10-31 10:11:12 | 显示全部楼层
RAL 发表于 2020-10-30 22:34
1、对,相同计算水平下得到的能量才能互相比较;
2、对,Gaussian里使用M06-2X泛函就是要写"M062X",可 ...

感谢解答
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