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[新手求助] 求助卟啉分子吸附在平面的表面增强拉曼光谱的计算问题

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楼主
老师们好,算表面增强拉曼光谱,卟啉分子吸附在一个平面上,固定平面算出来的卟啉的拉曼光谱 竟然比 单卟啉的拉曼光谱还弱很多,用的b3lyp/def2svp,第一次算表面增强,大家遇到过这种其概况吗?我应该怀疑的计算出错了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 13:44:20 | 只看该作者 Only view this author
# opt freq=raman b3lyp def2svp em=gd3bj

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发表于 Post on 2020-11-6 15:25:34 | 只看该作者 Only view this author
你的表面是什么?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2020-11-6 17:04:23 | 只看该作者 Only view this author
1.用的什么金属作为平面
2.卟啉分子接触位点和平面的距离

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发表于 Post on 2020-11-6 18:17:52 | 只看该作者 Only view this author
用普通DFT计算表面增强拉曼,一般来说明确的化学吸附算起来意义大一些,而且和你用什么、多大的簇关系很大。算SERS的方法很多,用DFT直接算并不明智。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 21:56:53 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-6 15:25
你的表面是什么?

老师,表面不是金属体系,是类似石墨烯的苯环和碳碳三键相连的平面。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 21:57:34 | 只看该作者 Only view this author
zkc0422 发表于 2020-11-6 17:04
1.用的什么金属作为平面
2.卟啉分子接触位点和平面的距离

老师,不是金属体系,距离3.25埃

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-6 21:58:26 | 只看该作者 Only view this author
Markmahao 发表于 2020-11-6 18:17
用普通DFT计算表面增强拉曼,一般来说明确的化学吸附算起来意义大一些,而且和你用什么、多大的簇关系很大 ...

学习了,谢谢老师

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发表于 Post on 2020-11-6 22:41:20 | 只看该作者 Only view this author
NicoleJiao 发表于 2020-11-6 21:56
老师,表面不是金属体系,是类似石墨烯的苯环和碳碳三键相连的平面。

那不就是石墨炔嘛

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发表于 Post on 2020-11-6 23:15:41 | 只看该作者 Only view this author
NicoleJiao 发表于 2020-11-6 21:56
老师,表面不是金属体系,是类似石墨烯的苯环和碳碳三键相连的平面。

基底是半导体吧?
半导体不一定有明显的SERS,SERS主要是金属有
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2020-11-7 17:30:06 | 只看该作者 Only view this author
怀疑计算结果之前,你先提供证据卟啉吸附在此类表面上确实有SERS现象
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-7 18:36:23 | 只看该作者 Only view this author

是的老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-7 18:39:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-6 23:15
基底是半导体吧?
半导体不一定有明显的SERS,SERS主要是金属有

好的老师,有一个问题请教您,卟啉吸附在石墨炔上,距离大约2.3埃,我对复合物进行优化的时候,要加em=gd3bj吗?我测试了一下,加上它和不加的能量差为0.4(log的输出结果直接做差)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-7 18:44:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-7 17:30
怀疑计算结果之前,你先提供证据卟啉吸附在此类表面上确实有SERS现象

嗯嗯好的老师,是给别人算的课题,我去详细了解下。
老师,还有一个问题:算吸附能,氧化石墨烯吸附在磷脂上,步骤:
1.在优化复合体系的时候必须要加em=gd3bj
2.然后分别单独算两个单体的单点能的时候,去掉em=gd3bj
3.最后根据吸附能的计算公式做差
这样理解对吗?我在分别算单体的单点能时忘记去掉em=gd3bj,之后又去掉计算了一遍单点能,发现差别还挺大。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-7 18:45:43 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-6 23:15
基底是半导体吧?
半导体不一定有明显的SERS,SERS主要是金属有

老师,这种体系,算opt和freq=raman的时候,都得加上em=gd3bj?

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