关于审稿人询问自旋污染的问题

LZLLLL

审稿人问：The authors considered different spin states for each metal center: have they checked the stability of the wavefunction and spin contamination in each structure?
我是用B3LYP/6-311G*，对过渡金属用的SDD基组优化的结构，而且结构都用stable=opt查看过波函数稳定性，都是稳定的，但是自旋污染要怎么查看呢？我翻了之前关于自旋污染的帖子，三重态的结构最终的输出 S**2 before annihilation     2.6160,   after     2.0203，   在2左右应该是可以忽略自旋污染的吧？那么该如何回复审稿人呢？

sobereva

你就把<S**2>告诉审稿人，说偏离理想值非常小，自旋污染可以忽略

LZLLLL

sobereva 发表于 2020-11-20 04:01
你就把告诉审稿人，说偏离理想值非常小，自旋污染可以忽略

好的，谢谢Sob老师

csu-77

借楼请教sob老师几个问题，先行感谢，近期论文收到了一条这样的审稿意见如下——“It is unclear why the authors chose the B3LYP functional, which is known for its limitations in describing transition metal complexes. This choice should be justified through a comparison with one or two other functionals or by citing relevant literature reports. Additionally, since the systems in this study have open-shell characteristics, the discussion should address spin contamination in the context of these systems.”

具体请教问题如下：
1）学生在做过渡金属（钴和锰）萃取的计算过程中，采用B3LYP-D3BJ/6-311G*进行的几何优化和振动分析，采用M062x-D3/ma-TZVP进行的单点能计算(计算体系中包含阴离子结构)，因为之前看过sob老师发布的一条评论，大致是：过渡金属萃取时，配合物中只有一个金属原子，用B3LYP也是可以接受的，所以针对上述审稿意见前半段的回复，可以直接引用一些过渡金属萃取过程计算用B3LYP泛函的文章，而不做不同泛函的对比嘛？
2）至于“Additionally, since the systems in this study have open-shell characteristics, the discussion should address spin contamination in the context of these systems.”，这个不知如何解答？还望得到老师的指导，万分感谢

zjxitcc

csu-77 发表于 2023-11-28 21:11
借楼请教sob老师几个问题，先行感谢，近期论文收到了一条这样的审稿意见如下——“It is unclear why the a ...

针对1) 前人“一些过渡金属萃取过程计算用B3LYP泛函的文章”不代表你也可以这么用、不代表你的体系也可以这么用，有些人瞎算算，审稿人没细看就给他混过去了。如果你不同泛函下几何结构很接近，审稿人自然不会过于刁难。

针对2) 像Sob在2L的回答那样，你先在文章SI里加上每个物种的<S**2>值，然后说一下自旋污染情况。稍微严谨一些的话，可以挑自旋污染最大的一两个物种算一下CCSD的T1诊断值，如果很小，审稿人往往就不会刁难你了。