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[建模与可视化] Multiwfn+VMD如何分析弱相互作用

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本帖最后由 jing-quan63 于 2020-12-3 20:43 编辑

大家好:
  最近借助sober老师帖子里的方法,采用IGM分析结合VMD可视化工具研究弱相互作用。得到如下图,由于非化学专业出身,但在论文中又想补充丰富论文内容,因此很想问问下图所示的相互作用应该如何分析讨论,另外想问问等值面分布的分布带(数值与颜色对应)怎么在VMD中调出来的,谢谢大家

(MI}[@%Z$F1_{]C@@T1D39E.png (41.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

(MI}[@%Z$F1_{]C@@T1D39E.png

WT@KACOM]4LZBSYGINVY50L.png (54.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

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发表于 Post on 2020-12-3 21:48:02 | 只看该作者 Only view this author
色彩刻度条自行把examples\RGB_bar.png文件ps上去就完了,两边标上数值上下限
仔细看IGM原文、我的博文(http://sobereva.com/407),已经给了足够的讨论例子。
另外,下面是部分使用Multiwfn做IGM分析已发表的文章标题,去搜原文,里面的讨论也可以作为例子
使用Multiwfn做IGM发表的文章.txt (10.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 129)

如果这篇还没看过一定要仔细看
使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-3 22:35:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-12-3 21:48
色彩刻度条自行把examples\RGB_bar.png文件ps上去就完了,两边标上数值上下限
仔细看IGM原文、我的博文(h ...

好的,非常感谢sob老师

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