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楼主 Author: 原子分子物理
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[Molpro] 求助molpro的casscf计算C2分子的垂直激发能

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发表于 Post on 2020-12-10 18:23:17 | 只看该作者 Only view this author
原子分子物理 发表于 2020-12-10 17:34
老师您这里面说的基态能量是指state1.1吗?因为我每个不可约表示算了两个态,所以有state1.1和state1.2, ...

基态永远是能量最低的那个态,你把所有态的能量比一下就知道了。一般而言,基态可能但不一定是state 1.1,应该完全按能量的高低来判断
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-10 19:00:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-12-10 18:23
基态永远是能量最低的那个态,你把所有态的能量比一下就知道了。一般而言,基态可能但不一定是state 1.1 ...

好的老师,我想我这次是真的理解了,真的谢谢老师,特别感谢您。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-10 21:39:45 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-12-10 18:23
基态永远是能量最低的那个态,你把所有态的能量比一下就知道了。一般而言,基态可能但不一定是state 1.1 ...

老师,不好意思,还有一个问题不是很清楚,文献中对C2分子的活化空间有的是CAS(8,8),有的是CAS(4,4),我之前算的是选的全部的价轨道,完整的输入卡是这样的:*** , C2
print ,basis , orbitals
geometry ={
c1
c2 ,c1 ,r
}

r=2.3 bohr
basis =avdz

{hf
wf ,12 ,1 ,0  
occ ,2,1,1,0,2,0,0,0
}

{ casscf
wf ,12 ,1 ,0 ;state ,1
wf ,12 ,2 ,0 ;state ,2
wf ,12 ,3 ,0 ;state ,2
wf ,12 ,4 ,0 ;state ,2
wf ,12 ,5 ,0 ;state ,2
wf ,12 ,6 ,0 ;state ,2
wf ,12 ,7 ,0 ;state ,2}
如果我想用CAS(4,4)这个活化空间,occ和closed应该怎么写啊,怎么在输入卡上体现出我用的活化空间是CAS(4,4)呢?MOLPRO手册上的态平均的例子都是选的全部价轨道,所以这个地方就有点疑问,请老师多多指教,感谢。

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发表于 Post on 2020-12-11 11:03:35 | 只看该作者 Only view this author
原子分子物理 发表于 2020-12-10 21:39
老师,不好意思,还有一个问题不是很清楚,文献中对C2分子的活化空间有的是CAS(8,8),有的是CAS(4,4),我之 ...

非态平均的例子应该有不选全部价轨道的例子吧?你参考非态平均的例子,再加上state, xxx指定态平均就行了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-11 11:29:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-12-11 11:03
非态平均的例子应该有不选全部价轨道的例子吧?你参考非态平均的例子,再加上state, xxx指定态平均就行了

首先感谢老师一直很耐心的解答我的疑问。有这样的例子,我已经尝试过CAS(6,6) ,但是算出来的的数值比文献中的数值偏高,老师我还想问一下,我想用CAS(4,4),但是需要交换轨道比如说:Occupied  (SGG) (SGU) (SGG) (SGU) (PIU) (PIU)
                                                      Virtual   (SGG) (PIG) (PIG) (SGU) (SGG) (PIU) (PIU) (SGG)
在这里面我想选用四个PI轨道,即PIU PIU PIG PIG 所以需要把空轨道中的SGG和PIG交换,我查到的资料是,比如:rotate,1,4,5.4,90,后面这个为什么是90,我在其他地方看到这个数值有写0的,这是有什么规则吗?还有就是这个命令应该是写在哪里啊,是写在{hf}这一部分还是{casscf}?

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发表于 Post on 2020-12-11 11:36:48 | 只看该作者 Only view this author
MOLCAS手册里面有C2的计算例子,虽然两个软件有所不同,但你仔细分析一下相关内容估计会对你理解计算有所帮助
http://www.molcas.org/documentat ... 6112000000000000000

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发表于 Post on 2020-12-11 12:58:44 | 只看该作者 Only view this author
原子分子物理 发表于 2020-12-11 11:29
首先感谢老师一直很耐心的解答我的疑问。有这样的例子,我已经尝试过CAS(6,6) ,但是算出来的的数值比文 ...

交换轨道是90
交换需要写在casscf部分,因为是通过读取hf轨道并对其进行交换

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-11 15:03:27 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2020-12-11 11:36
MOLCAS手册里面有C2的计算例子,虽然两个软件有所不同,但你仔细分析一下相关内容估计会对你理解计算有所帮 ...

感谢,感谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-11 15:07:10 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2020-12-11 12:58
交换轨道是90
交换需要写在casscf部分,因为是通过读取hf轨道并对其进行交换

感谢老师,我也猜测是写在CASSCF部分,虽然提交程序没有报错,但是心里不确定到底对不对,我的课题跟师兄师姐们的不一样,他们也不用molpro,所以都是自己摸索猜测,特别感谢老师这几天一直耐心的指导,谢谢老师。

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发表于 Post on 2020-12-15 19:23:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-12-16 13:31 编辑

担心自己结果不对、不会交换轨道、不知道如何选活性轨道,可以用 自动做多参考计算的程序MOKIT (https://gitlab.com/jxzou/mokit) 试算一下,以三重态C2为例,输入文件如下
  1. %mem=8GB
  2. %nprocshared=8
  3. #p CASSCF(8,8)/aug-cc-pVTZ

  4. mokit{casscf_prog=molpro}

  5. 0 3
  6. C   0.0   0.0   0.0
  7. C   0.0   0.0   2.0

复制代码

整个过程是自动的,不用你看、选轨道,只要你机子上装有Gaussian, PySCF(免费开源), GAMESS(免费开源), Molpro等软件,(安装MOKIT后)会自动调用相应模块,8核8GB下算这个例子仅需23s时间。而人工手动一步步来耗时长多了。结果是
E(CASSCF) =       -75.48488843 a.u.
仅供参考。当然了,这只是基态的单点,但你可以用算完的molpro文件读取之、做后续计算,就不用再看、调轨道了。


自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-16 11:36:18 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-12-15 19:23
担心自己结果不对、不会交换轨道、不知道如何选活性轨道,可以用 自动做多参考计算的程序MOKIT (https://gi ...

MOLPRO在服务器里也可以调用吗?

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发表于 Post on 2020-12-16 13:04:45 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-12-16 13:30 编辑
原子分子物理 发表于 2020-12-16 11:36
MOLPRO在服务器里也可以调用吗?

如果你指的是 在主节点提交,作业调度系统(如bsub, qsub等)会将其分配到子节点计算 这种形式的话,你可以在主节点提交MOKIT作业,MOKIT任务会被分配到子节点,它会在子节点里调用molpro,不用你做啥。

如果你指的服务器没有作业调度系统的话、当前节点直接可以计算,那更简单了,你只要能执行which molpro查看到molpro路径,那MOKIT自然也能调用。

另外,MOKIT没有用对称性,如果你要用对称性,可能要考虑读取算完的molpro输出文件、波函数文件等开了对称性再续算,或者自己仍手动算、不用MOKIT。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2020-12-16 20:57:29 | 只看该作者 Only view this author
楼主好!

想问一下您的moloro的quickstart可以分享一下吗?最近也在学molpro,想要做一些简单的练手

非常感谢!!

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发表于 Post on 2020-12-16 21:21:03 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2020-12-16 20:57
楼主好!

想问一下您的moloro的quickstart可以分享一下吗?最近也在学molpro,想要做一些简单的练手

quickstart.pdf在解压后的doc文件夹中,可自行下载
http://bbs.keinsci.com/thread-15060-1-1.html
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-17 09:11:50 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2020-12-16 20:57
楼主好!

想问一下您的moloro的quickstart可以分享一下吗?最近也在学molpro,想要做一些简单的练手

我也是在这个论坛上找的,下面有老师发的链接,你可以下载一下。

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